More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1803 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 499 aa  1023    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3737  extracellular solute-binding protein  36.02 
 
 		 517 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 		 505 aa  219  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 495 aa  219  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  30.27 
 
 		 497 aa  213  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  29.08 
 
 		 514 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 495 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 528 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 		 527 aa  196  8.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 535 aa  192  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  27.29 
 
 		 516 aa  192  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  27.1 
 
 		 516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.83 
 
 		 521 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.83 
 
 		 521 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 521 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.83 
 
 		 521 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.61 
 
 		 521 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 530 aa  183  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 		 520 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 521 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  26.01 
 
 		 509 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 526 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 		 512 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  29.21 
 
 		 526 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 535 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  32.1 
 
 		 521 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 		 509 aa  177  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.59 
 
 		 521 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  27.61 
 
 		 532 aa  176  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.6 
 
 		 530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  27.86 
 
 		 537 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.51 
 
 		 510 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0184  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 		 518 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 549 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.76 
 
 		 512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  28.72 
 
 		 522 aa  174  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 526 aa  173  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  28.6 
 
 		 525 aa  172  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 527 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 		 533 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 517 aa  170  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  27.38 
 
 		 533 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  30.91 
 
 		 513 aa  170  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  26.55 
 
 		 528 aa  169  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  26.15 
 
 		 528 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  30.16 
 
 		 513 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 524 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.04 
 
 		 502 aa  167  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29 
 
 		 520 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0028  extracellular solute-binding protein family 5  30.43 
 
 		 520 aa  167  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 532 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  25.35 
 
 		 532 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 		 509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  29 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.88 
 
 		 528 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  30.13 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 498 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 531 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 520 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 538 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.96 
 
 		 534 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1815  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 532 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 		 520 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  29.24 
 
 		 495 aa  162  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  29.58 
 
 		 518 aa  161  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  26.62 
 
 		 522 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.57 
 
 		 512 aa  160  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  29.08 
 
 		 520 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.57 
 
 		 512 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.57 
 
 		 512 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.87 
 
 		 535 aa  159  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.42 
 
 		 542 aa  159  9e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 515 aa  159  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  28.37 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 544 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  28.37 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.37 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 520 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 511 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  27.77 
 
 		 534 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 519 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 538 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 526 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  25.11 
 
 		 516 aa  157  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.16 
 
 		 512 aa  156  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 509 aa  156  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  27.77 
 
 		 534 aa  156  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  28.43 
 
 		 520 aa  156  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  28.45 
 
 		 523 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 492 aa  156  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.72 
 
 		 508 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  27.08 
 
 		 509 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  24.8 
 
 		 516 aa  155  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 		 517 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 489 aa  154  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.42 
 
 		 544 aa  153  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.98 
 
 		 541 aa  154  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>