More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6651 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
498 aa  1022    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  51.26 
 
 
502 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  49.8 
 
 
502 aa  507  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  52.08 
 
 
500 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  48.48 
 
 
490 aa  461  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  50.2 
 
 
503 aa  448  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  46.03 
 
 
490 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5083  4-phytase  46.49 
 
 
495 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.116329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  44.58 
 
 
495 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  40.2 
 
 
501 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  39 
 
 
495 aa  359  8e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  37.13 
 
 
552 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  35.44 
 
 
517 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  33.74 
 
 
521 aa  240  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  32.23 
 
 
519 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.4 
 
 
510 aa  222  9e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 
510 aa  219  8.999999999999998e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  30.47 
 
 
516 aa  219  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  30.54 
 
 
534 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  30.92 
 
 
535 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 
515 aa  209  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  31.12 
 
 
511 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.97 
 
 
508 aa  206  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  31.52 
 
 
509 aa  203  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  30.53 
 
 
520 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  30.21 
 
 
505 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
510 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  31.02 
 
 
520 aa  200  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.43 
 
 
513 aa  200  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30.55 
 
 
512 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  29.42 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  29.42 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  29.42 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30.55 
 
 
512 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30.55 
 
 
512 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  30 
 
 
509 aa  197  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30.55 
 
 
512 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  31.85 
 
 
508 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  30.35 
 
 
512 aa  195  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30.35 
 
 
512 aa  195  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4369  extracellular solute-binding protein family 5  30.42 
 
 
536 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  30.14 
 
 
512 aa  192  9e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  30.14 
 
 
512 aa  192  9e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  29.11 
 
 
521 aa  191  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 
520 aa  191  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.98 
 
 
505 aa  190  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  29.84 
 
 
512 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 
520 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.9 
 
 
521 aa  189  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.9 
 
 
521 aa  189  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  28.9 
 
 
521 aa  189  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 
521 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  30.02 
 
 
493 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  29.64 
 
 
512 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
520 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  29.64 
 
 
512 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
520 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  29.64 
 
 
512 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
520 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  29.84 
 
 
512 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 
517 aa  188  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6371  extracellular solute-binding protein family 5  30.74 
 
 
504 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  29.79 
 
 
520 aa  187  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 
535 aa  186  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  30.58 
 
 
514 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  30.68 
 
 
514 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6191  extracellular solute-binding protein family 5  30.95 
 
 
504 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172417  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 
520 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  29.42 
 
 
520 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  28.48 
 
 
523 aa  184  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.62 
 
 
520 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  29.59 
 
 
520 aa  183  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.59 
 
 
520 aa  183  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  29.59 
 
 
520 aa  183  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  29.59 
 
 
520 aa  183  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  29.59 
 
 
520 aa  183  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  29.59 
 
 
520 aa  183  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  29.59 
 
 
520 aa  183  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.61 
 
 
526 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.61 
 
 
526 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.61 
 
 
526 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  29.5 
 
 
527 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.4 
 
 
526 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  30.37 
 
 
513 aa  181  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.4 
 
 
526 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 
503 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  30.93 
 
 
517 aa  180  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  31.3 
 
 
513 aa  179  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.92 
 
 
503 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  31.09 
 
 
518 aa  179  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 
516 aa  179  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 
519 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 
518 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  29.96 
 
 
513 aa  177  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 
528 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 
512 aa  176  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  30.21 
 
 
508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  29.61 
 
 
524 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  29.04 
 
 
541 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>