More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_16530 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 		 510 aa  1028    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  69.57 
 
 		 512 aa  695    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  69.57 
 
 		 512 aa  695    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  65.03 
 
 		 510 aa  653    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  69.57 
 
 		 512 aa  695    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  65.69 
 
 		 515 aa  661    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  58.38 
 
 		 510 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  59.63 
 
 		 516 aa  601  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  59.43 
 
 		 511 aa  592  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  52.34 
 
 		 512 aa  526  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  54.27 
 
 		 523 aa  525  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  35.24 
 
 		 505 aa  279  7e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  34 
 
 		 520 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  31.76 
 
 		 502 aa  253  5.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  33.47 
 
 		 509 aa  251  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  35.74 
 
 		 528 aa  249  6e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  36.02 
 
 		 532 aa  247  4e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  32.44 
 
 		 534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  32.63 
 
 		 535 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  30.62 
 
 		 517 aa  241  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  32.41 
 
 		 546 aa  237  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 		 490 aa  235  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  32.3 
 
 		 495 aa  231  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  33.75 
 
 		 524 aa  229  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3804  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 501 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000726853  hitchhiker  0.0000406829 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.88 
 
 		 538 aa  228  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.94 
 
 		 521 aa  227  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.94 
 
 		 521 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.94 
 
 		 521 aa  227  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  28.94 
 
 		 521 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 		 521 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  31.58 
 
 		 519 aa  223  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  32.29 
 
 		 505 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 498 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  31.46 
 
 		 538 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  31.81 
 
 		 534 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.48 
 
 		 504 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  34.18 
 
 		 523 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 539 aa  219  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  32.15 
 
 		 500 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  31.01 
 
 		 533 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  34.8 
 
 		 492 aa  219  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  30.44 
 
 		 540 aa  217  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 522 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  29.94 
 
 		 540 aa  216  8e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  31.37 
 
 		 531 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.33 
 
 		 540 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  35.14 
 
 		 506 aa  214  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.29 
 
 		 492 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  30.86 
 
 		 541 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.29 
 
 		 479 aa  213  7e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  30.63 
 
 		 520 aa  212  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  30.86 
 
 		 502 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  31.43 
 
 		 503 aa  212  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 		 528 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  32.52 
 
 		 508 aa  212  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  31.14 
 
 		 502 aa  210  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.34 
 
 		 520 aa  209  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  32.32 
 
 		 524 aa  209  7e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  33.04 
 
 		 505 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  32.8 
 
 		 514 aa  209  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  28.77 
 
 		 527 aa  209  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 510 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  31.59 
 
 		 493 aa  208  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  32.49 
 
 		 522 aa  207  4e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  30.79 
 
 		 515 aa  203  7e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  30.72 
 
 		 595 aa  203  8e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  31.42 
 
 		 524 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  33.12 
 
 		 522 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  31.79 
 
 		 502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  32.19 
 
 		 516 aa  200  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  30.95 
 
 		 512 aa  200  6e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8313  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.04 
 
 		 516 aa  199  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291124  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 509 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 525 aa  198  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1235  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.97 
 
 		 542 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650831  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  29.94 
 
 		 544 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  30.63 
 
 		 503 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  30.83 
 
 		 503 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  33.18 
 
 		 489 aa  196  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  30.35 
 
 		 526 aa  196  7e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  28.49 
 
 		 503 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  31.63 
 
 		 529 aa  195  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 509 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  28.46 
 
 		 535 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  28.46 
 
 		 535 aa  195  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.46 
 
 		 535 aa  195  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  32.03 
 
 		 524 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.46 
 
 		 535 aa  195  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.46 
 
 		 535 aa  195  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  28.46 
 
 		 535 aa  195  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  28.46 
 
 		 535 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.46 
 
 		 535 aa  195  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  32.12 
 
 		 551 aa  195  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  31.09 
 
 		 516 aa  195  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  32.48 
 
 		 492 aa  194  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  28.77 
 
 		 535 aa  194  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.28 
 
 		 508 aa  194  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  30.22 
 
 		 531 aa  194  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  29.45 
 
 		 509 aa  194  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>