More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0479 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  100 
 
 
535 aa  1092    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  87.83 
 
 
534 aa  981    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  54.31 
 
 
524 aa  535  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  45.83 
 
 
565 aa  483  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  41.73 
 
 
530 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  40.53 
 
 
541 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  42.97 
 
 
525 aa  398  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  40.94 
 
 
528 aa  394  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  41.88 
 
 
529 aa  392  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  40.39 
 
 
535 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  40.59 
 
 
535 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  40.59 
 
 
535 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  41.88 
 
 
528 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  40.45 
 
 
535 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  40 
 
 
535 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  41.55 
 
 
538 aa  385  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  40.26 
 
 
535 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  40.26 
 
 
535 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  40.26 
 
 
535 aa  381  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  40.26 
 
 
535 aa  381  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  39.89 
 
 
535 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  40.26 
 
 
535 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  40.63 
 
 
526 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  40.26 
 
 
535 aa  381  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  40.26 
 
 
535 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  40.45 
 
 
526 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  40.45 
 
 
526 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  38.5 
 
 
544 aa  376  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  40.45 
 
 
526 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  40.45 
 
 
526 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  40.75 
 
 
537 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  39.29 
 
 
547 aa  372  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  39.61 
 
 
535 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  40.39 
 
 
532 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  40.16 
 
 
531 aa  372  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  39.61 
 
 
535 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  40.39 
 
 
532 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  39.61 
 
 
535 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  39.26 
 
 
532 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  39.03 
 
 
530 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  39.22 
 
 
530 aa  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  38.7 
 
 
547 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  38.99 
 
 
547 aa  367  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  37.59 
 
 
547 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  39.42 
 
 
535 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  39.96 
 
 
537 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  39.45 
 
 
531 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  39.49 
 
 
533 aa  364  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  39.69 
 
 
546 aa  363  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  36.8 
 
 
542 aa  363  4e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  40.19 
 
 
532 aa  363  4e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  39.69 
 
 
533 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  39.14 
 
 
531 aa  360  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  38.09 
 
 
542 aa  359  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  39.18 
 
 
532 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  38.57 
 
 
545 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  37.65 
 
 
542 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  37.89 
 
 
543 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  38.68 
 
 
506 aa  350  3e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  38.65 
 
 
541 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  38.63 
 
 
531 aa  349  6e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  37.71 
 
 
541 aa  349  7e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  38.65 
 
 
541 aa  349  8e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  38.36 
 
 
531 aa  348  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  38.04 
 
 
531 aa  347  3e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  38.65 
 
 
541 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  38.52 
 
 
529 aa  347  4e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  38.49 
 
 
532 aa  346  5e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3064  extracellular solute-binding protein  37 
 
 
542 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.150422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2431  extracellular solute-binding protein  37 
 
 
542 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3045  extracellular solute-binding protein  37 
 
 
542 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3040  extracellular solute-binding protein  36.85 
 
 
542 aa  346  7e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.607327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  35.42 
 
 
589 aa  345  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4558  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  37.36 
 
 
540 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.44901  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  39.11 
 
 
532 aa  343  4e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  37.36 
 
 
542 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2956  extracellular solute-binding protein  35.99 
 
 
542 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  38.22 
 
 
526 aa  342  7e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3090  extracellular solute-binding protein  35.99 
 
 
542 aa  342  8e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  37.28 
 
 
531 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6392  ABC oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  36.3 
 
 
542 aa  340  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  36.89 
 
 
531 aa  340  5e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1949  extracellular solute-binding protein  39.73 
 
 
542 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0969647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0220  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  36.21 
 
 
542 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63568  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4294  extracellular solute-binding protein  35.99 
 
 
530 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.502669  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0923  extracellular solute-binding protein  36.31 
 
 
530 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0437  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  36.95 
 
 
574 aa  336  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0243  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  37.02 
 
 
542 aa  336  7e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0256  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  37.02 
 
 
542 aa  336  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3508  extracellular solute-binding protein  37.25 
 
 
553 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360798 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2121  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  36.57 
 
 
536 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443402  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3301  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  36.64 
 
 
542 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3378  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  36.64 
 
 
542 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2969  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  36.64 
 
 
542 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  37.36 
 
 
520 aa  332  7.000000000000001e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  35.8 
 
 
532 aa  332  7.000000000000001e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0927  extracellular solute-binding protein  36.52 
 
 
530 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  34.38 
 
 
532 aa  331  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  36.67 
 
 
531 aa  331  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0884  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  36.13 
 
 
530 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0511525  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>