More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3863 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  67.8 
 
 		 512 aa  655    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 523 aa  1057    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  60.68 
 
 		 510 aa  607  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  60.41 
 
 		 511 aa  580  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  54.36 
 
 		 512 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  54.36 
 
 		 512 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  54.36 
 
 		 512 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  54.66 
 
 		 510 aa  533  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  54.6 
 
 		 515 aa  528  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  54.31 
 
 		 510 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  50.62 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  35.32 
 
 		 505 aa  258  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  29.17 
 
 		 517 aa  217  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.6 
 
 		 521 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.6 
 
 		 521 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.6 
 
 		 521 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 		 521 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  28.6 
 
 		 521 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 		 522 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  32.85 
 
 		 519 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  32.25 
 
 		 502 aa  210  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 		 490 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  32.35 
 
 		 503 aa  206  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  30.21 
 
 		 500 aa  200  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  31.26 
 
 		 523 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.34 
 
 		 535 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  29.94 
 
 		 495 aa  196  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 		 534 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.78 
 
 		 520 aa  194  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.08 
 
 		 504 aa  194  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 510 aa  193  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.69 
 
 		 509 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  31.28 
 
 		 524 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  30.72 
 
 		 532 aa  190  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  31.98 
 
 		 508 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  29.06 
 
 		 524 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  33.41 
 
 		 492 aa  187  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3804  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 501 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000726853  hitchhiker  0.0000406829 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 528 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.18 
 
 		 532 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 		 595 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 498 aa  183  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 		 492 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  31.61 
 
 		 529 aa  180  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  28 
 
 		 541 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  30.38 
 
 		 556 aa  179  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 517 aa  179  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  30.66 
 
 		 495 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  31.03 
 
 		 516 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  29.4 
 
 		 501 aa  178  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  29.65 
 
 		 502 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.13 
 
 		 479 aa  176  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.43 
 
 		 540 aa  176  9e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  28.21 
 
 		 524 aa  176  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.13 
 
 		 492 aa  176  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  30.66 
 
 		 521 aa  176  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  31.12 
 
 		 546 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  30.08 
 
 		 516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  33.51 
 
 		 522 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  27.47 
 
 		 516 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 		 512 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  27.88 
 
 		 527 aa  172  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4354  extracellular solute-binding protein family 5  30.67 
 
 		 497 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148655  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  29.98 
 
 		 533 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  29.75 
 
 		 509 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 516 aa  170  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  29.29 
 
 		 610 aa  170  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  31.74 
 
 		 503 aa  170  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 489 aa  170  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  29.39 
 
 		 502 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 		 517 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  31.41 
 
 		 529 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  31.61 
 
 		 517 aa  168  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 		 505 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  27.62 
 
 		 516 aa  168  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.59 
 
 		 545 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  28.46 
 
 		 565 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3842  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 		 568 aa  168  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450891  normal  0.108057 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  28.66 
 
 		 528 aa  167  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2482  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 582 aa  167  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  28.85 
 
 		 490 aa  167  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 519 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  26.37 
 
 		 517 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 		 494 aa  166  6.9999999999999995e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1235  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.61 
 
 		 542 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650831  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.38 
 
 		 540 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  31.43 
 
 		 531 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 547 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4082  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 526 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484283  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 		 516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  29.18 
 
 		 533 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5083  4-phytase  29.91 
 
 		 495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.116329 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 		 503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  27.39 
 
 		 516 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  27.39 
 
 		 516 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 531 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1805  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.33 
 
 		 525 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.74 
 
 		 503 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  29.91 
 
 		 552 aa  164  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 531 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.265556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>