More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4082 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4082  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 526 aa  1073    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484283  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.72 
 
 		 521 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.72 
 
 		 521 aa  170  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.72 
 
 		 521 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 521 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.05 
 
 		 521 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  28.76 
 
 		 523 aa  166  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  30.08 
 
 		 534 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 510 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.83 
 
 		 510 aa  160  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  28.6 
 
 		 532 aa  159  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.9 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 528 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.06 
 
 		 535 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 511 aa  146  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 515 aa  146  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  24.76 
 
 		 524 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.61 
 
 		 509 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  24.26 
 
 		 532 aa  144  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 510 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  26.82 
 
 		 533 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  28.43 
 
 		 533 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  27.26 
 
 		 522 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1344  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 506 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.088373  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1097  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein, putative  29.53 
 
 		 518 aa  137  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 		 519 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  26.56 
 
 		 522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  25.45 
 
 		 509 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0459  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 504 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435025  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  26.95 
 
 		 502 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  24.49 
 
 		 527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1271  ABC transporter, periplasmic binding protein  27.48 
 
 		 528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000259921  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  26.85 
 
 		 528 aa  131  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  27.97 
 
 		 505 aa  130  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  27.52 
 
 		 503 aa  130  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 507 aa  130  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  25.77 
 
 		 527 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 535 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  25.31 
 
 		 514 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  25.69 
 
 		 503 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  28.07 
 
 		 516 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 528 aa  128  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  28.3 
 
 		 527 aa  128  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  24.44 
 
 		 516 aa  128  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 520 aa  128  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0028  extracellular solute-binding protein family 5  26.61 
 
 		 520 aa  128  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  23.98 
 
 		 516 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  25.81 
 
 		 516 aa  127  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  26.58 
 
 		 532 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 522 aa  126  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1189  4-phytase  26.65 
 
 		 523 aa  126  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  26.58 
 
 		 532 aa  126  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  26.9 
 
 		 514 aa  126  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.91 
 
 		 507 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.41 
 
 		 565 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 528 aa  126  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  27.25 
 
 		 518 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6955  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  29.14 
 
 		 597 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2267  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.12 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  28.64 
 
 		 541 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.05 
 
 		 512 aa  125  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  27.29 
 
 		 524 aa  124  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 508 aa  124  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 489 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 535 aa  124  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1897  extracellular solute-binding protein family 5  27.58 
 
 		 554 aa  124  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  26.08 
 
 		 526 aa  124  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.88 
 
 		 530 aa  124  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  26.36 
 
 		 545 aa  124  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1968  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 518 aa  123  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 510 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 512 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  24.39 
 
 		 522 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0449  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  27.06 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  27.06 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.06 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.2 
 
 		 520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.06 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.86 
 
 		 512 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 535 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  27.06 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.86 
 
 		 512 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  24.43 
 
 		 512 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  27.06 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08370  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.12 
 
 		 547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.86 
 
 		 512 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.06 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  24.86 
 
 		 512 aa  121  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.7 
 
 		 527 aa  121  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  25.57 
 
 		 513 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  24.86 
 
 		 512 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.86 
 
 		 512 aa  121  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>