More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0449 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0449  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 522 aa  1061    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0780  extracellular solute-binding protein family 5  34.32 
 
 		 511 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.142319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0426  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 511 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  32.35 
 
 		 509 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.22 
 
 		 508 aa  170  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  29.67 
 
 		 508 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2510  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 519 aa  167  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  29.57 
 
 		 527 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27800  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.14 
 
 		 528 aa  157  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0422  extracellular solute-binding protein family 5  30.89 
 
 		 517 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.941021 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.22 
 
 		 521 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.22 
 
 		 521 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.22 
 
 		 521 aa  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.22 
 
 		 521 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 521 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2763  extracellular solute-binding protein family 5  27.9 
 
 		 518 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  30.32 
 
 		 534 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  33.12 
 
 		 503 aa  147  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0371  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  26.47 
 
 		 543 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  33.51 
 
 		 544 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 535 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 528 aa  141  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  27.84 
 
 		 517 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.18 
 
 		 535 aa  140  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  31.46 
 
 		 510 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 493 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 535 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  27.24 
 
 		 509 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  27.67 
 
 		 519 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  32.18 
 
 		 498 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  28.08 
 
 		 517 aa  137  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 525 aa  136  8e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  28.43 
 
 		 532 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  30.98 
 
 		 494 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  30.66 
 
 		 492 aa  136  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 492 aa  136  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  26.65 
 
 		 537 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  28.43 
 
 		 532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 530 aa  134  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3804  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 501 aa  134  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000726853  hitchhiker  0.0000406829 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  33.42 
 
 		 562 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0232  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 519 aa  131  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3049  extracellular solute-binding protein family 5  31.48 
 
 		 503 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 538 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26 
 
 		 528 aa  130  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  27.44 
 
 		 504 aa  130  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.85 
 
 		 479 aa  130  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.85 
 
 		 492 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  27.97 
 
 		 528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  28.96 
 
 		 533 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.27 
 
 		 513 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  26.17 
 
 		 531 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1930  extracellular solute-binding protein family 5  28.33 
 
 		 499 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 520 aa  128  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  30.97 
 
 		 533 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 514 aa  127  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  29.16 
 
 		 517 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  31.27 
 
 		 506 aa  127  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  29.26 
 
 		 514 aa  127  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3973  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 549 aa  126  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 521 aa  126  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  28.83 
 
 		 556 aa  126  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.41 
 
 		 510 aa  126  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  33.93 
 
 		 539 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  32.57 
 
 		 505 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  30.7 
 
 		 502 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  30.79 
 
 		 556 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  31.9 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  28.8 
 
 		 526 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 507 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  30.47 
 
 		 514 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 489 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.14 
 
 		 503 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1771  extracellular solute-binding protein family 5  27.82 
 
 		 547 aa  124  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 		 544 aa  123  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 503 aa  123  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 		 505 aa  123  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  29.38 
 
 		 544 aa  123  8e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  26.69 
 
 		 523 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 564 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  29.17 
 
 		 528 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  32.84 
 
 		 531 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  28.17 
 
 		 541 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 517 aa  122  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6472  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  29.43 
 
 		 495 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.01 
 
 		 540 aa  121  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0689  extracellular solute-binding protein family 5  27.55 
 
 		 544 aa  121  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  27.06 
 
 		 533 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 512 aa  121  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  31.12 
 
 		 509 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  25.75 
 
 		 513 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 		 534 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  27.55 
 
 		 526 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  25.75 
 
 		 513 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 549 aa  120  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  27.35 
 
 		 522 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>