More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0426 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0426  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 511 aa  1052    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0449  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 522 aa  216  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0780  extracellular solute-binding protein family 5  29.85 
 
 		 511 aa  204  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.142319 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0422  extracellular solute-binding protein family 5  27.98 
 
 		 517 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.941021 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.19 
 
 		 534 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  27.95 
 
 		 509 aa  127  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.56 
 
 		 535 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  26.55 
 
 		 519 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 555 aa  124  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2014  twin-arginine translocation pathway signal  29.23 
 
 		 534 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.533924  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  29.92 
 
 		 502 aa  121  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6472  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  27.41 
 
 		 495 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 544 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1014  extracellular solute-binding protein family 5  29.57 
 
 		 523 aa  120  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 493 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 544 aa  118  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  26.56 
 
 		 508 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.46 
 
 		 542 aa  117  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.28 
 
 		 566 aa  117  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 518 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2510  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3804  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000726853  hitchhiker  0.0000406829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4354  extracellular solute-binding protein family 5  27.84 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148655  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4355  extracellular solute-binding protein family 5  28.77 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0355555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2402  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.76 
 
 		 538 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.85 
 
 		 539 aa  115  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 		 520 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.87 
 
 		 520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  26.87 
 
 		 520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.87 
 
 		 520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.87 
 
 		 520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  26.87 
 
 		 520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.87 
 
 		 520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.87 
 
 		 520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27800  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.72 
 
 		 528 aa  114  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 510 aa  114  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  26.46 
 
 		 520 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  27.97 
 
 		 533 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.6 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.6 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  27.6 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.6 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.6 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  27.6 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.6 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.91 
 
 		 493 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  26.76 
 
 		 610 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  26.74 
 
 		 528 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.83 
 
 		 508 aa  109  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3507  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3993  extracellular solute-binding protein family 5  29.02 
 
 		 531 aa  109  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 		 528 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 512 aa  109  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  30.96 
 
 		 537 aa  109  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.25 
 
 		 540 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 509 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1930  extracellular solute-binding protein family 5  30.07 
 
 		 499 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 509 aa  108  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  25.44 
 
 		 517 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 495 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 		 537 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  24.8 
 
 		 513 aa  107  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 530 aa  107  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 510 aa  107  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  27.03 
 
 		 512 aa  107  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  25.33 
 
 		 513 aa  107  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  25.49 
 
 		 521 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  27.03 
 
 		 512 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  25.3 
 
 		 514 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 535 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  29.15 
 
 		 517 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 540 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1518  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  24.43 
 
 		 538 aa  105  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000374669  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  26.73 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  26.73 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.51 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3973  extracellular solute-binding protein family 5  26.77 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 495 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  25 
 
 		 515 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  26.73 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 520 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3049  extracellular solute-binding protein family 5  24.46 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  27.97 
 
 		 531 aa  105  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 551 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  26.57 
 
 		 540 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 520 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 520 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 		 532 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  27.04 
 
 		 517 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 		 532 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 516 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 514 aa  103  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0750  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  26.81 
 
 		 559 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 520 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 520 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.2 
 
 		 517 aa  103  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  25.72 
 
 		 520 aa  103  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  26.32 
 
 		 520 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  26.02 
 
 		 518 aa  103  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.96 
 
 		 520 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>