More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1979 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  100 
 
 		 516 aa  1060    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  51.85 
 
 		 512 aa  557  1e-157  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  37.35 
 
 		 545 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  35.96 
 
 		 519 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  36.19 
 
 		 524 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2405  extracellular solute-binding protein family 5  36.29 
 
 		 518 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  32.6 
 
 		 537 aa  269  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  32.95 
 
 		 524 aa  264  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3809  extracellular solute-binding protein family 5  31.16 
 
 		 521 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2017  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 		 523 aa  253  7e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0245155  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  31.37 
 
 		 521 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  31.44 
 
 		 521 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  31.44 
 
 		 521 aa  247  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  31.44 
 
 		 521 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  31.44 
 
 		 521 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1341  extracellular solute-binding protein  31.63 
 
 		 500 aa  243  9e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  31.59 
 
 		 520 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  32.32 
 
 		 517 aa  240  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.87 
 
 		 525 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0145  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.79 
 
 		 521 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  31.94 
 
 		 509 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.64 
 
 		 520 aa  232  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2069  extracellular solute-binding protein family 5  30.21 
 
 		 518 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2388  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 522 aa  224  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51940  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 510 aa  221  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000130332  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  30.37 
 
 		 527 aa  218  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  32.99 
 
 		 551 aa  214  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  30.22 
 
 		 540 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 538 aa  212  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 		 522 aa  212  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 510 aa  209  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  30.72 
 
 		 540 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 		 528 aa  208  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  28.97 
 
 		 546 aa  206  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  29.29 
 
 		 532 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  30.62 
 
 		 515 aa  205  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 		 522 aa  204  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 		 565 aa  203  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  30.39 
 
 		 532 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0360  extracellular solute-binding protein family 5  29.35 
 
 		 506 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  31.73 
 
 		 537 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  30.89 
 
 		 505 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  30.35 
 
 		 508 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.66 
 
 		 508 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.3 
 
 		 538 aa  200  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.19 
 
 		 510 aa  200  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.04 
 
 		 550 aa  200  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 		 528 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  29.51 
 
 		 541 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2595  putative extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 		 507 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975919 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03325  nickel transporter subunit  30.06 
 
 		 524 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03278  hypothetical protein  30.06 
 
 		 524 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4816  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  30.06 
 
 		 524 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0239  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.06 
 
 		 524 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3675  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  30.06 
 
 		 524 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0240  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.06 
 
 		 524 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3958  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  30.06 
 
 		 524 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 		 539 aa  197  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  28.54 
 
 		 531 aa  196  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3760  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  29.86 
 
 		 524 aa  196  9e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3845  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  29.86 
 
 		 524 aa  195  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  32.71 
 
 		 511 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.89 
 
 		 511 aa  195  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7613  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  28.88 
 
 		 526 aa  193  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  26.25 
 
 		 502 aa  193  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 521 aa  192  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  29.64 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  30.92 
 
 		 533 aa  192  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  29.33 
 
 		 519 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  29.22 
 
 		 502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 515 aa  190  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4050  extracellular solute-binding protein family 5  28.09 
 
 		 548 aa  189  7e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3005  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.29 
 
 		 488 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 510 aa  189  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2402  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.45 
 
 		 538 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  29.21 
 
 		 562 aa  187  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 		 559 aa  187  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  29.91 
 
 		 509 aa  186  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 512 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0473  nickel ABC transporter, solute-binding protein  29.29 
 
 		 538 aa  186  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 512 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 512 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 		 551 aa  186  9e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 		 510 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  30.25 
 
 		 544 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1834  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  29.89 
 
 		 523 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.250373  hitchhiker  0.0023879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  30.28 
 
 		 534 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0337  extracellular solute-binding protein family 5  27.88 
 
 		 521 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.25 
 
 		 505 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  29.82 
 
 		 576 aa  183  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  29.98 
 
 		 509 aa  183  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.04 
 
 		 535 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  30.77 
 
 		 526 aa  182  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.77 
 
 		 526 aa  182  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.82 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3342  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.91 
 
 		 524 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 		 526 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  28.03 
 
 		 520 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 535 aa  180  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 509 aa  180  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>