More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36530 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 		 566 aa  1163    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0206  extracellular solute-binding protein family 5  55.79 
 
 		 561 aa  650    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646254  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19540  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  61.05 
 
 		 567 aa  671    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.394832  normal  0.058637 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0658  extracellular solute-binding protein family 5  58.01 
 
 		 577 aa  668    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0480  extracellular solute-binding protein family 5  51.15 
 
 		 569 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105843  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0216  extracellular solute-binding protein  50.47 
 
 		 553 aa  524  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.923383 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  48.51 
 
 		 556 aa  498  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0255  extracellular solute-binding protein  49.81 
 
 		 554 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192685  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  47.07 
 
 		 556 aa  483  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3638  extracellular solute-binding protein family 5  47.57 
 
 		 555 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339986  normal  0.415005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  46.28 
 
 		 610 aa  463  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  47.34 
 
 		 560 aa  463  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6149  extracellular solute-binding protein family 5  41.98 
 
 		 566 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.784749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2548  extracellular solute-binding protein  35.46 
 
 		 584 aa  342  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0070372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  35.44 
 
 		 534 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  38.05 
 
 		 524 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2285  extracellular solute-binding protein family 5  34.29 
 
 		 535 aa  302  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000852999 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  35.61 
 
 		 535 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  36.92 
 
 		 595 aa  291  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  35.37 
 
 		 565 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  34.22 
 
 		 525 aa  274  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  35.01 
 
 		 528 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  35.77 
 
 		 529 aa  271  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  33.93 
 
 		 541 aa  259  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  33.65 
 
 		 532 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  33.65 
 
 		 532 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.66 
 
 		 535 aa  247  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  32.48 
 
 		 535 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  32.48 
 
 		 535 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.48 
 
 		 535 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  32.48 
 
 		 535 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.48 
 
 		 535 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  32.48 
 
 		 535 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.48 
 
 		 535 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  32.31 
 
 		 526 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  32.31 
 
 		 526 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.31 
 
 		 526 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  32.31 
 
 		 526 aa  243  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  33.95 
 
 		 528 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  32.12 
 
 		 526 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 		 538 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  31.6 
 
 		 589 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  31.42 
 
 		 535 aa  238  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.42 
 
 		 535 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  31.42 
 
 		 535 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3283  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 		 545 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 		 535 aa  238  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  31.46 
 
 		 535 aa  236  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  34.07 
 
 		 532 aa  236  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  31.26 
 
 		 535 aa  235  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  30.92 
 
 		 535 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 		 542 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  32.13 
 
 		 530 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  30.36 
 
 		 535 aa  226  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  30.36 
 
 		 535 aa  225  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  31.45 
 
 		 547 aa  224  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  31.44 
 
 		 532 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  31.77 
 
 		 531 aa  219  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  32.58 
 
 		 537 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.86 
 
 		 541 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 		 541 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  32.08 
 
 		 537 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  30.26 
 
 		 532 aa  217  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  31.41 
 
 		 531 aa  217  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  31.04 
 
 		 541 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  31 
 
 		 531 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  31.68 
 
 		 533 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 		 532 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 		 531 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 532 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  29.03 
 
 		 541 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 541 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  29.6 
 
 		 546 aa  213  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  31.05 
 
 		 533 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1615  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 541 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577375  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 		 545 aa  210  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 		 541 aa  210  7e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1500  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 		 541 aa  209  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 530 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  29.87 
 
 		 531 aa  208  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 		 506 aa  208  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08450  Predicted extracellular solute-binding protein, family 5  30.43 
 
 		 554 aa  207  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.891256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  30.66 
 
 		 531 aa  207  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 		 541 aa  208  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1638  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 525 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  28.8 
 
 		 541 aa  207  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1604  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 525 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2065  extracellular solute-binding protein family 5  30.07 
 
 		 543 aa  206  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 547 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 533 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 529 aa  205  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 		 543 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4558  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  30.86 
 
 		 540 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.44901  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  31.68 
 
 		 532 aa  204  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3775  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.04 
 
 		 556 aa  204  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  31.89 
 
 		 531 aa  204  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 542 aa  204  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  30.06 
 
 		 531 aa  204  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4294  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 		 530 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.502669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 531 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>