More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3804 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  61.07 
 
 
510 aa  636    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3804  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
501 aa  1004    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000726853  hitchhiker  0.0000406829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  39.78 
 
 
508 aa  330  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  33.07 
 
 
502 aa  265  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.33 
 
 
510 aa  228  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  31.74 
 
 
532 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 
510 aa  211  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  31.38 
 
 
505 aa  209  9e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 
512 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 
512 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 
512 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 
515 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  30.92 
 
 
512 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 
510 aa  200  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  31.03 
 
 
516 aa  192  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 
511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  29.89 
 
 
514 aa  188  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  29.33 
 
 
523 aa  186  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.91 
 
 
540 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 
551 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.43 
 
 
521 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.43 
 
 
521 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.43 
 
 
521 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
521 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.61 
 
 
504 aa  168  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.22 
 
 
521 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.41 
 
 
534 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
538 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  26.4 
 
 
517 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  29.81 
 
 
519 aa  164  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  29.84 
 
 
502 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  30.51 
 
 
522 aa  163  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 
509 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.22 
 
 
516 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 
493 aa  162  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 
501 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  25.82 
 
 
524 aa  160  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.71 
 
 
535 aa  159  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  27.51 
 
 
546 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 
535 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  30.42 
 
 
538 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  26.15 
 
 
535 aa  157  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3842  extracellular solute-binding protein  28.73 
 
 
568 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450891  normal  0.108057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  29.71 
 
 
509 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  27.03 
 
 
523 aa  156  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  25.95 
 
 
535 aa  156  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  29.53 
 
 
529 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  25.98 
 
 
535 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  28.6 
 
 
529 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  27.71 
 
 
531 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  26.22 
 
 
534 aa  154  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.88 
 
 
525 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 
529 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 
528 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  26.01 
 
 
533 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  24.95 
 
 
535 aa  153  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  24.95 
 
 
535 aa  153  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.95 
 
 
535 aa  153  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 
519 aa  153  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.29 
 
 
538 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
490 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 
534 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.27 
 
 
540 aa  151  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  25.2 
 
 
535 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  26.86 
 
 
531 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
525 aa  150  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.49 
 
 
541 aa  150  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  27.54 
 
 
517 aa  150  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  27.98 
 
 
540 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  26.83 
 
 
495 aa  149  9e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 
509 aa  149  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  26.86 
 
 
533 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.65 
 
 
520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.98 
 
 
509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  27.29 
 
 
503 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 
522 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
540 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 
503 aa  147  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  29.2 
 
 
514 aa  147  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 
522 aa  147  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.45 
 
 
520 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  27.57 
 
 
502 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 
531 aa  146  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 
517 aa  146  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  26.24 
 
 
520 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  27.22 
 
 
503 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
516 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 
498 aa  146  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 
516 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  28.43 
 
 
516 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  23.96 
 
 
516 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5538  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 
528 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332617  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 
520 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 
520 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  27.74 
 
 
516 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.14 
 
 
508 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
531 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.05 
 
 
542 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9144  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.57 
 
 
507 aa  144  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>