More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2375 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 514 aa  1047    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  34.65 
 
 		 514 aa  262  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9144  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.88 
 
 		 507 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  34.09 
 
 		 502 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8313  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.31 
 
 		 516 aa  215  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291124  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 512 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 512 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 512 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.69 
 
 		 510 aa  208  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  33.12 
 
 		 515 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  32.42 
 
 		 510 aa  204  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 510 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  31.07 
 
 		 505 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  31.91 
 
 		 512 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  29.58 
 
 		 516 aa  192  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3804  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000726853  hitchhiker  0.0000406829 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.86 
 
 		 520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  29.88 
 
 		 546 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  30.25 
 
 		 540 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 		 528 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.9 
 
 		 537 aa  182  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  29.88 
 
 		 519 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  28.85 
 
 		 532 aa  180  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 		 537 aa  180  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  29.31 
 
 		 534 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  27.11 
 
 		 515 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  30.41 
 
 		 509 aa  177  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  29.17 
 
 		 537 aa  176  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 521 aa  176  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 541 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1604  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 		 525 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1638  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 		 525 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  27.31 
 
 		 541 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  29.08 
 
 		 541 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.63 
 
 		 531 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 541 aa  174  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.47 
 
 		 535 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 535 aa  172  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1615  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 541 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577375  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1500  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 541 aa  170  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  28.02 
 
 		 533 aa  170  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 510 aa  169  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  31.3 
 
 		 535 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.29 
 
 		 538 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  30.98 
 
 		 544 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  29.56 
 
 		 497 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 538 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  33.49 
 
 		 505 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  28.51 
 
 		 535 aa  167  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.9 
 
 		 532 aa  167  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  31.67 
 
 		 508 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 544 aa  166  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  29.32 
 
 		 518 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 521 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  29 
 
 		 504 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 511 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 534 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 520 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 		 536 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 520 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.93 
 
 		 520 aa  163  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 		 534 aa  163  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.45 
 
 		 521 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.45 
 
 		 521 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.45 
 
 		 521 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 521 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1805  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.52 
 
 		 525 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4211  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 504 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.79 
 
 		 541 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  28.52 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2482  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 582 aa  162  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 		 536 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 539 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 		 540 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.43 
 
 		 525 aa  161  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.25 
 
 		 512 aa  161  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3449  extracellular solute-binding protein family 5  32.08 
 
 		 515 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.802426 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.23 
 
 		 521 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.25 
 
 		 512 aa  160  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.25 
 
 		 512 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.25 
 
 		 512 aa  160  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  27.5 
 
 		 520 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 525 aa  160  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  29.25 
 
 		 512 aa  159  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.7 
 
 		 520 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  29.25 
 
 		 512 aa  159  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  26.31 
 
 		 516 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 525 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 536 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1235  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.34 
 
 		 542 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650831  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 503 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  30.12 
 
 		 545 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  27.6 
 
 		 517 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  27.51 
 
 		 524 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 537 aa  158  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  28.91 
 
 		 533 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2580  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 541 aa  158  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.2 
 
 		 540 aa  157  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.41 
 
 		 503 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>