More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18790 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 		 540 aa  1083    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  32.86 
 
 		 505 aa  248  3e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  33.33 
 
 		 502 aa  246  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  30.59 
 
 		 541 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  30.4 
 
 		 521 aa  233  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.4 
 
 		 521 aa  233  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  30.21 
 
 		 521 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  30.4 
 
 		 521 aa  233  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 		 521 aa  233  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.49 
 
 		 534 aa  232  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.4 
 
 		 535 aa  230  6e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  30.02 
 
 		 524 aa  229  9e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 		 528 aa  228  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  33.12 
 
 		 519 aa  226  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.49 
 
 		 510 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  32.99 
 
 		 511 aa  220  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 		 510 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  31.01 
 
 		 495 aa  217  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 		 512 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 		 512 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 		 512 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  30.71 
 
 		 503 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  30.5 
 
 		 503 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  31 
 
 		 502 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 565 aa  206  8e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  32.62 
 
 		 510 aa  206  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  30.54 
 
 		 517 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.34 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.69 
 
 		 532 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 		 515 aa  200  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 522 aa  200  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6191  extracellular solute-binding protein family 5  29.17 
 
 		 504 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172417  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  28.9 
 
 		 544 aa  199  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.41 
 
 		 539 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6371  extracellular solute-binding protein family 5  28.96 
 
 		 504 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  30.13 
 
 		 515 aa  196  9e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 519 aa  195  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  30 
 
 		 532 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5088  extracellular solute-binding protein family 5  28.73 
 
 		 553 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.416607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 516 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 		 521 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.17 
 
 		 538 aa  193  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 		 538 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  28.4 
 
 		 565 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2226  extracellular solute-binding protein family 5  30.23 
 
 		 507 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.41 
 
 		 542 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  28.6 
 
 		 526 aa  190  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  29.35 
 
 		 546 aa  190  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  29.19 
 
 		 523 aa  190  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  30.02 
 
 		 525 aa  190  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 		 510 aa  190  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 520 aa  190  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 535 aa  189  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  28.72 
 
 		 516 aa  189  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 544 aa  189  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31.42 
 
 		 528 aa  188  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3804  extracellular solute-binding protein  30.91 
 
 		 501 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000726853  hitchhiker  0.0000406829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 517 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  26.49 
 
 		 520 aa  187  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  31.21 
 
 		 523 aa  187  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  30 
 
 		 509 aa  187  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 		 517 aa  187  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  28.35 
 
 		 547 aa  187  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  28.63 
 
 		 504 aa  187  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 529 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31 
 
 		 516 aa  186  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3040  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 542 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.607327 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  28.22 
 
 		 544 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  31.61 
 
 		 512 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 527 aa  186  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  28.21 
 
 		 515 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 547 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  29.78 
 
 		 516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  32.37 
 
 		 494 aa  185  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.65 
 
 		 547 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  27.23 
 
 		 535 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  27.23 
 
 		 535 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  27.23 
 
 		 535 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4211  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 		 504 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.23 
 
 		 535 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.23 
 
 		 535 aa  184  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  27.23 
 
 		 535 aa  184  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.23 
 
 		 535 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.23 
 
 		 535 aa  184  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2956  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 542 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3090  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 542 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  26.69 
 
 		 532 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  29.17 
 
 		 516 aa  183  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  29.17 
 
 		 516 aa  183  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.27 
 
 		 542 aa  183  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 532 aa  183  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  29.17 
 
 		 516 aa  183  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  31.63 
 
 		 528 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  31.09 
 
 		 531 aa  182  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  27.68 
 
 		 576 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3064  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 542 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150422 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 516 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.13 
 
 		 534 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2431  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 542 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3045  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 542 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>