More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0431 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 522 aa  1075    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  37.23 
 
 		 503 aa  329  7e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  32.99 
 
 		 493 aa  250  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  33.94 
 
 		 508 aa  247  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  32.38 
 
 		 505 aa  236  7e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  32.75 
 
 		 509 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 		 492 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6472  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  33.61 
 
 		 495 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  33.26 
 
 		 508 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  34.36 
 
 		 492 aa  225  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.27 
 
 		 492 aa  223  9e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.27 
 
 		 479 aa  222  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  32.3 
 
 		 516 aa  221  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 		 512 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 		 512 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 		 512 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4354  extracellular solute-binding protein family 5  30 
 
 		 497 aa  220  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148655  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0816  extracellular solute-binding protein family 5  31.06 
 
 		 496 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0887  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 		 496 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 495 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.98 
 
 		 510 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 510 aa  213  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 494 aa  212  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0139  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 		 502 aa  212  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.184027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  29.67 
 
 		 501 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 515 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  30.87 
 
 		 502 aa  210  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  31.07 
 
 		 489 aa  209  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  30.74 
 
 		 499 aa  209  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4355  extracellular solute-binding protein family 5  29.92 
 
 		 495 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0355555  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 538 aa  207  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.65 
 
 		 538 aa  206  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 510 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.55 
 
 		 507 aa  204  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  28.44 
 
 		 546 aa  203  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  29.64 
 
 		 523 aa  200  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5441  extracellular solute-binding protein  30.63 
 
 		 497 aa  199  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.876365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  32.7 
 
 		 507 aa  199  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.05 
 
 		 534 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 539 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29.38 
 
 		 520 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  29.88 
 
 		 528 aa  194  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 528 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.75 
 
 		 535 aa  193  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3842  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 		 568 aa  193  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450891  normal  0.108057 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 		 565 aa  192  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 		 533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  31.21 
 
 		 505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0459  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 		 504 aa  190  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435025  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3049  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 		 503 aa  188  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  27.91 
 
 		 534 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  27.94 
 
 		 495 aa  188  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  29.46 
 
 		 532 aa  187  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  28.77 
 
 		 509 aa  186  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  30.85 
 
 		 520 aa  186  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  31.39 
 
 		 538 aa  186  9e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.03 
 
 		 520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  24.95 
 
 		 540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 505 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 		 514 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  31.48 
 
 		 540 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  29.39 
 
 		 521 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  31.48 
 
 		 540 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  29.39 
 
 		 521 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.39 
 
 		 521 aa  182  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  29.39 
 
 		 521 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 521 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 		 544 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.42 
 
 		 512 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 540 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 		 576 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  31.48 
 
 		 540 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 517 aa  180  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  29.54 
 
 		 519 aa  180  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 		 534 aa  178  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.02 
 
 		 534 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  27.94 
 
 		 527 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.61 
 
 		 540 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.66 
 
 		 516 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  30.39 
 
 		 520 aa  178  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2226  extracellular solute-binding protein family 5  27.23 
 
 		 507 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0130  extracellular solute-binding protein family 5  28.18 
 
 		 542 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  28.22 
 
 		 524 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 534 aa  175  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  28.39 
 
 		 545 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 		 509 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  29.01 
 
 		 524 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 544 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.23 
 
 		 524 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.94 
 
 		 534 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 535 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.84 
 
 		 516 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.41 
 
 		 529 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  28.94 
 
 		 535 aa  170  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  25.98 
 
 		 531 aa  170  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  28.79 
 
 		 527 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  25.81 
 
 		 517 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.94 
 
 		 532 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 535 aa  169  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>