More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1913 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
535 aa  1092    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  47.13 
 
 
541 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  45.91 
 
 
538 aa  472  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  44.69 
 
 
535 aa  467  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  43.93 
 
 
534 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2238  extracellular solute-binding protein family 5  44.75 
 
 
534 aa  444  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00707838  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  45.68 
 
 
533 aa  438  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  43.02 
 
 
542 aa  432  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  42.5 
 
 
552 aa  419  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  42.29 
 
 
545 aa  411  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  40.04 
 
 
531 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  43.18 
 
 
541 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1590  extracellular solute-binding protein family 5  43.78 
 
 
530 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2024  extracellular solute-binding protein family 5  40.83 
 
 
536 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000427312  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0586  extracellular solute-binding protein family 5  42.03 
 
 
544 aa  402  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0603  extracellular solute-binding protein family 5  41.98 
 
 
534 aa  396  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1602  extracellular solute-binding protein family 5  42.83 
 
 
534 aa  390  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2170  extracellular solute-binding protein family 5  44.31 
 
 
535 aa  387  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1803  extracellular solute-binding protein family 5  39.56 
 
 
537 aa  383  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551859  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1982  extracellular solute-binding protein  38.25 
 
 
543 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.17175 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  40.26 
 
 
544 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0267  extracellular solute-binding protein family 5  39.69 
 
 
538 aa  369  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  36.78 
 
 
550 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  41.28 
 
 
536 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  38.24 
 
 
530 aa  365  1e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  40.08 
 
 
555 aa  361  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  39.09 
 
 
543 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  37.41 
 
 
530 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  40.11 
 
 
544 aa  355  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  39.85 
 
 
545 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  40.57 
 
 
543 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  40.57 
 
 
543 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  40.57 
 
 
543 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  39.85 
 
 
545 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  40.57 
 
 
543 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  39.88 
 
 
554 aa  350  5e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  40.57 
 
 
543 aa  349  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  38.25 
 
 
525 aa  349  8e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  38.52 
 
 
543 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  38.52 
 
 
558 aa  348  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  38.52 
 
 
543 aa  348  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  38.52 
 
 
543 aa  348  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  38.52 
 
 
558 aa  348  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  38.52 
 
 
543 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  35.74 
 
 
549 aa  348  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  38.52 
 
 
558 aa  348  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  38.52 
 
 
558 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  37.9 
 
 
532 aa  347  3e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  40.23 
 
 
525 aa  347  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  38.34 
 
 
543 aa  347  4e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5413  4-phytase  39.52 
 
 
537 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0115  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  37.33 
 
 
536 aa  346  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4866  extracellular solute-binding protein  39.31 
 
 
537 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  38.75 
 
 
545 aa  344  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  38.52 
 
 
537 aa  344  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4730  extracellular solute-binding protein  37.45 
 
 
537 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3850  extracellular solute-binding protein family 5  37.45 
 
 
522 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5318  extracellular solute-binding protein  37.26 
 
 
537 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177529  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  40.68 
 
 
533 aa  343  5e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5542  extracellular solute-binding protein  37.26 
 
 
537 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.390888  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.76 
 
 
525 aa  342  7e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.72 
 
 
525 aa  341  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2438  extracellular solute-binding protein  36.47 
 
 
526 aa  340  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  38.81 
 
 
556 aa  340  4e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3263  extracellular solute-binding protein  37.26 
 
 
537 aa  340  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35798  normal  0.0152453 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3311  putative binding protein  38.13 
 
 
535 aa  339  8e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43332  normal  0.120975 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4505  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 
538 aa  339  8e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.347947 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  38.71 
 
 
558 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  39.2 
 
 
556 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02892  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  37.94 
 
 
535 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.922865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0680  extracellular solute-binding protein family 5  37.94 
 
 
535 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0677  putative binding protein  37.94 
 
 
535 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02842  hypothetical protein  37.94 
 
 
535 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.81173  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3198  putative binding protein  37.94 
 
 
535 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4331  putative binding protein  37.74 
 
 
535 aa  336  7e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  38.26 
 
 
547 aa  335  9e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  37.52 
 
 
547 aa  335  9e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  35.86 
 
 
535 aa  334  3e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  36.93 
 
 
532 aa  332  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  38.06 
 
 
545 aa  332  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2027  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  37.43 
 
 
555 aa  331  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.197641  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  39.47 
 
 
545 aa  330  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  37.25 
 
 
537 aa  330  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  38.28 
 
 
537 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  38.28 
 
 
537 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  38.28 
 
 
537 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  38.28 
 
 
537 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  37.87 
 
 
537 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  38.28 
 
 
537 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  38.28 
 
 
537 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  38.28 
 
 
537 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1328  extracellular solute-binding protein  40.55 
 
 
534 aa  328  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1253  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.77 
 
 
554 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1569  extracellular solute-binding protein  40.55 
 
 
534 aa  327  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199164  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0351  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.77 
 
 
554 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1534  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.77 
 
 
554 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1724  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.77 
 
 
554 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532344  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3019  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.77 
 
 
554 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2903  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.77 
 
 
554 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0385  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.77 
 
 
554 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.918509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>