More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2743 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  60.15 
 
 
534 aa  665    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2238  extracellular solute-binding protein family 5  58.4 
 
 
534 aa  643    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00707838  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
542 aa  1115    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  62.12 
 
 
535 aa  684    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1590  extracellular solute-binding protein family 5  53.49 
 
 
530 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1803  extracellular solute-binding protein family 5  53.08 
 
 
537 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0603  extracellular solute-binding protein family 5  52.26 
 
 
534 aa  556  1e-157  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  51.56 
 
 
533 aa  535  1e-151  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1602  extracellular solute-binding protein family 5  49.81 
 
 
534 aa  523  1e-147  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0586  extracellular solute-binding protein family 5  48.33 
 
 
544 aa  514  1e-144  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  46.43 
 
 
531 aa  491  1e-137  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2024  extracellular solute-binding protein family 5  45.98 
 
 
536 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000427312  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2170  extracellular solute-binding protein family 5  47.98 
 
 
535 aa  468  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  44.74 
 
 
538 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  43.91 
 
 
541 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  43.02 
 
 
535 aa  432  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0267  extracellular solute-binding protein family 5  41.2 
 
 
538 aa  424  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  40.07 
 
 
552 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0728  extracellular solute-binding protein family 5  40.85 
 
 
535 aa  390  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  37.08 
 
 
545 aa  349  9e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  35.38 
 
 
550 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  33.4 
 
 
541 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  34.33 
 
 
530 aa  303  5.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  33.27 
 
 
535 aa  300  5e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  35.85 
 
 
536 aa  297  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  34.95 
 
 
544 aa  296  9e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1328  extracellular solute-binding protein  35.46 
 
 
534 aa  292  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  35.12 
 
 
543 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1569  extracellular solute-binding protein  35.46 
 
 
534 aa  290  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199164  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1982  extracellular solute-binding protein  32.72 
 
 
543 aa  287  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.17175 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  37.09 
 
 
537 aa  286  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  33.73 
 
 
532 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  34.61 
 
 
532 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1612  extracellular solute-binding protein family 5  33.57 
 
 
549 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2219  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.02 
 
 
550 aa  277  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  32.82 
 
 
530 aa  276  5e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  32.26 
 
 
539 aa  276  8e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  34.91 
 
 
558 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 
533 aa  274  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  31.84 
 
 
525 aa  272  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  33.71 
 
 
537 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  33.71 
 
 
537 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  33.71 
 
 
537 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  33.77 
 
 
537 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  33.71 
 
 
537 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  33.71 
 
 
537 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  33.71 
 
 
537 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  33.71 
 
 
537 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  34.39 
 
 
549 aa  271  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0756  extracellular solute-binding protein family 5  34.65 
 
 
549 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  33.33 
 
 
537 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  33.33 
 
 
537 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  33.14 
 
 
537 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  33.14 
 
 
537 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  34.81 
 
 
555 aa  269  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  33.52 
 
 
537 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  32.95 
 
 
537 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  32.72 
 
 
542 aa  266  8.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1253  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.16 
 
 
554 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  32.19 
 
 
558 aa  265  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 
545 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  31.38 
 
 
543 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.38 
 
 
543 aa  264  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.38 
 
 
543 aa  264  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.76 
 
 
558 aa  264  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0351  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.16 
 
 
554 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3852  extracellular solute-binding protein family 5  32.14 
 
 
536 aa  264  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000990708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.53 
 
 
545 aa  264  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  31.38 
 
 
543 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  32.53 
 
 
525 aa  264  3e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1534  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.16 
 
 
554 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1724  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.16 
 
 
554 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532344  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3019  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.16 
 
 
554 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2903  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.16 
 
 
554 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0385  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.16 
 
 
554 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.918509  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  33.66 
 
 
526 aa  264  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  32.19 
 
 
558 aa  264  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.19 
 
 
558 aa  264  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  32.99 
 
 
533 aa  263  6.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  33.2 
 
 
526 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  30.34 
 
 
547 aa  262  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  31.45 
 
 
560 aa  262  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3850  extracellular solute-binding protein family 5  32.39 
 
 
522 aa  262  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3263  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 
537 aa  262  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35798  normal  0.0152453 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 
526 aa  262  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003657  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  34.41 
 
 
536 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 
544 aa  261  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  31.39 
 
 
528 aa  260  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  32.39 
 
 
547 aa  260  6e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2601  extracellular solute-binding protein family 5  32.53 
 
 
538 aa  259  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1846  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  33.27 
 
 
553 aa  259  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673607  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.02 
 
 
525 aa  259  8e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.38 
 
 
543 aa  259  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  32.32 
 
 
545 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  33.82 
 
 
549 aa  259  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4866  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 
537 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  33.41 
 
 
543 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1856  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  32.78 
 
 
553 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.882448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2031  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  32.32 
 
 
553 aa  257  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0757  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.06 
 
 
538 aa  258  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>