More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0592 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 545 aa  1122    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  50.2 
 
 		 526 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  49.6 
 
 		 526 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  45.97 
 
 		 533 aa  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  45.58 
 
 		 529 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0865  extracellular solute-binding protein  42.4 
 
 		 544 aa  446  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  45.38 
 
 		 529 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  44.69 
 
 		 529 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  43.51 
 
 		 525 aa  433  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  43.7 
 
 		 525 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  44.85 
 
 		 525 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  44.66 
 
 		 528 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  43.92 
 
 		 532 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3462  extracellular solute-binding protein  43.41 
 
 		 552 aa  430  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0173201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  44.25 
 
 		 549 aa  429  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  42.64 
 
 		 532 aa  422  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  40 
 
 		 532 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5343  extracellular solute-binding protein  41.08 
 
 		 535 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220066  normal  0.0289508 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  41.95 
 
 		 525 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0468  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  41.75 
 
 		 525 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  40.96 
 
 		 526 aa  392  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  41.35 
 
 		 525 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  40.2 
 
 		 532 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2885  extracellular solute-binding protein  39.64 
 
 		 528 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128734  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4787  extracellular solute-binding protein family 5  39.2 
 
 		 532 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6093  extracellular solute-binding protein family 5  40.16 
 
 		 528 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  40.81 
 
 		 533 aa  362  1e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  39.68 
 
 		 561 aa  358  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  39.56 
 
 		 544 aa  358  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  39.13 
 
 		 536 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  40.45 
 
 		 543 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  40.45 
 
 		 543 aa  349  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  40.45 
 
 		 543 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  40.45 
 
 		 543 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  40.45 
 
 		 543 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  38.73 
 
 		 535 aa  348  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.66 
 
 		 543 aa  346  5e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  37.45 
 
 		 558 aa  345  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.45 
 
 		 558 aa  345  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  37.32 
 
 		 543 aa  345  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  37.45 
 
 		 558 aa  345  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.32 
 
 		 543 aa  345  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.32 
 
 		 543 aa  345  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.45 
 
 		 558 aa  345  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  37.32 
 
 		 543 aa  345  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.27 
 
 		 543 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  38.48 
 
 		 558 aa  342  7e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  38.54 
 
 		 554 aa  340  5.9999999999999996e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  39.06 
 
 		 556 aa  339  7e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  37.43 
 
 		 556 aa  335  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 		 544 aa  335  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  36.77 
 
 		 542 aa  334  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.69 
 
 		 545 aa  333  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 549 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2438  extracellular solute-binding protein  38.07 
 
 		 526 aa  332  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  36.48 
 
 		 555 aa  331  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0020  extracellular solute-binding protein  35.61 
 
 		 558 aa  331  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 545 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  36.71 
 
 		 545 aa  330  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  38.9 
 
 		 525 aa  330  4e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  37.09 
 
 		 537 aa  329  7e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  35.74 
 
 		 545 aa  327  4.0000000000000003e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  37.03 
 
 		 547 aa  323  6e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  35.31 
 
 		 543 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  36.29 
 
 		 547 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  37.63 
 
 		 545 aa  321  3e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  37.5 
 
 		 541 aa  318  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  35.11 
 
 		 539 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2654  extracellular solute-binding protein family 5  37.65 
 
 		 544 aa  313  5.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.411058  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  36.72 
 
 		 537 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  36.72 
 
 		 537 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  36.72 
 
 		 537 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  36.72 
 
 		 537 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  36.72 
 
 		 537 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  36.72 
 
 		 537 aa  313  6.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  36.72 
 
 		 537 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  36.72 
 
 		 537 aa  312  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  38.46 
 
 		 541 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0333  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 528 aa  311  2e-83  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.31964  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0334  extracellular solute-binding protein  37.02 
 
 		 541 aa  309  9e-83  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.768653  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  36.31 
 
 		 537 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  35.52 
 
 		 538 aa  307  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2286  extracellular solute-binding protein family 5  36.74 
 
 		 545 aa  307  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2389  murein tripeptide ABC transporter periplasmic murein peptide-binding protein  35.52 
 
 		 538 aa  307  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  36.33 
 
 		 552 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1569  extracellular solute-binding protein  36.72 
 
 		 534 aa  306  7e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199164  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  35.52 
 
 		 538 aa  306  8.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2601  extracellular solute-binding protein family 5  35.28 
 
 		 538 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1735  extracellular solute-binding protein family 5  36.74 
 
 		 538 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4505  extracellular solute-binding protein  36.2 
 
 		 538 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.347947 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2148  extracellular solute-binding protein  35.76 
 
 		 538 aa  303  6.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  36.53 
 
 		 537 aa  303  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1328  extracellular solute-binding protein  36.51 
 
 		 534 aa  303  7.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  36.53 
 
 		 537 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  36.53 
 
 		 537 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  36.33 
 
 		 537 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  36.33 
 
 		 537 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3853  4-phytase  35.2 
 
 		 528 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  34.87 
 
 		 560 aa  299  9e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2611  extracellular solute-binding protein  34.36 
 
 		 544 aa  299  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.502409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>