More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0537 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  69.9 
 
 		 525 aa  767    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  100 
 
 		 525 aa  1089    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  70.86 
 
 		 525 aa  768    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  59.96 
 
 		 529 aa  662    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  88.57 
 
 		 525 aa  981    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  99.24 
 
 		 525 aa  1079    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  67.24 
 
 		 526 aa  760    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0468  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  70.67 
 
 		 525 aa  763    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  59.58 
 
 		 529 aa  659    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  61.25 
 
 		 529 aa  686    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  50.48 
 
 		 533 aa  570  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  49.71 
 
 		 532 aa  506  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  46.44 
 
 		 532 aa  474  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  45.18 
 
 		 532 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3462  extracellular solute-binding protein  43.92 
 
 		 552 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0173201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4787  extracellular solute-binding protein family 5  45.04 
 
 		 532 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  45.44 
 
 		 532 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  43.53 
 
 		 528 aa  452  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2885  extracellular solute-binding protein  43.43 
 
 		 528 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128734  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  43.22 
 
 		 526 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5343  extracellular solute-binding protein  43.31 
 
 		 535 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220066  normal  0.0289508 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  44.44 
 
 		 545 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  42.25 
 
 		 526 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  43.03 
 
 		 549 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6093  extracellular solute-binding protein family 5  42.32 
 
 		 528 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  39.29 
 
 		 547 aa  355  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  40.04 
 
 		 543 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  39.47 
 
 		 558 aa  348  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  40.08 
 
 		 547 aa  348  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  39.84 
 
 		 543 aa  346  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  38.9 
 
 		 543 aa  346  6e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  39.84 
 
 		 543 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  39.84 
 
 		 543 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  39.84 
 
 		 543 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  38.37 
 
 		 543 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  38.37 
 
 		 543 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  38.37 
 
 		 558 aa  344  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  38.37 
 
 		 558 aa  345  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  38.37 
 
 		 543 aa  344  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  38.37 
 
 		 558 aa  344  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  38.37 
 
 		 558 aa  345  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  38.37 
 
 		 543 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  39.21 
 
 		 561 aa  341  2e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  37.72 
 
 		 535 aa  341  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0865  extracellular solute-binding protein  36.29 
 
 		 544 aa  341  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.5 
 
 		 543 aa  339  8e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  38.4 
 
 		 554 aa  339  9e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  37.62 
 
 		 556 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  39.38 
 
 		 545 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  38.97 
 
 		 545 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  38.97 
 
 		 545 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  38.81 
 
 		 525 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  38.7 
 
 		 555 aa  337  3.9999999999999995e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  38.54 
 
 		 556 aa  334  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  39.39 
 
 		 544 aa  334  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  37.24 
 
 		 536 aa  333  6e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  38.01 
 
 		 545 aa  330  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  39.2 
 
 		 533 aa  325  2e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  37.71 
 
 		 537 aa  319  6e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2286  extracellular solute-binding protein family 5  37.63 
 
 		 545 aa  319  7.999999999999999e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1569  extracellular solute-binding protein  37.99 
 
 		 534 aa  319  7.999999999999999e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199164  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  36.73 
 
 		 560 aa  318  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  37.47 
 
 		 559 aa  317  4e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  36.69 
 
 		 541 aa  316  6e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2601  extracellular solute-binding protein family 5  36.71 
 
 		 538 aa  316  7e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1328  extracellular solute-binding protein  37.78 
 
 		 534 aa  316  7e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 545 aa  315  9e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  36.59 
 
 		 537 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0020  extracellular solute-binding protein  38.82 
 
 		 558 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  34.22 
 
 		 543 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  37.69 
 
 		 539 aa  312  7.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  35.41 
 
 		 544 aa  312  7.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2611  extracellular solute-binding protein  36.11 
 
 		 544 aa  310  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.502409 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  37.42 
 
 		 541 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 		 542 aa  309  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  35.02 
 
 		 539 aa  306  6e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2319  extracellular solute-binding protein family 5  35.37 
 
 		 538 aa  306  8.000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  35.44 
 
 		 537 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  35.44 
 
 		 537 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  35.44 
 
 		 537 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  35.44 
 
 		 537 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  35.44 
 
 		 537 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  35.44 
 
 		 537 aa  301  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  35.44 
 
 		 537 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  35.44 
 
 		 537 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0351  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.6 
 
 		 554 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1534  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.6 
 
 		 554 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1724  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.6 
 
 		 554 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532344  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3019  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.6 
 
 		 554 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2903  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.6 
 
 		 554 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0385  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.6 
 
 		 554 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.918509  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1253  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.6 
 
 		 554 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3263  extracellular solute-binding protein  35.21 
 
 		 537 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35798  normal  0.0152453 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  34.43 
 
 		 538 aa  300  5e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  35.44 
 
 		 537 aa  300  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4730  extracellular solute-binding protein  35.01 
 
 		 537 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1735  extracellular solute-binding protein family 5  36.16 
 
 		 538 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2219  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.25 
 
 		 550 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5318  extracellular solute-binding protein  35.01 
 
 		 537 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177529  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5542  extracellular solute-binding protein  35.01 
 
 		 537 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.390888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>