More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1588 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2024  extracellular solute-binding protein family 5  62.76 
 
 
536 aa  693    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000427312  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
533 aa  1095    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2170  extracellular solute-binding protein family 5  55.62 
 
 
535 aa  587  1e-166  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  49.81 
 
 
534 aa  541  9.999999999999999e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  51.56 
 
 
542 aa  535  1e-151  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  50.56 
 
 
531 aa  535  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  49.81 
 
 
535 aa  529  1e-149  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2238  extracellular solute-binding protein family 5  50.84 
 
 
534 aa  529  1e-149  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00707838  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0603  extracellular solute-binding protein family 5  48.88 
 
 
534 aa  504  1e-141  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1590  extracellular solute-binding protein family 5  46.63 
 
 
530 aa  479  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1602  extracellular solute-binding protein family 5  46.44 
 
 
534 aa  473  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1803  extracellular solute-binding protein family 5  45.15 
 
 
537 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0586  extracellular solute-binding protein family 5  42.49 
 
 
544 aa  444  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  45.68 
 
 
535 aa  438  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  43.09 
 
 
541 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0267  extracellular solute-binding protein family 5  40.19 
 
 
538 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  40.75 
 
 
538 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  38.83 
 
 
545 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  39.15 
 
 
552 aa  353  5e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0728  extracellular solute-binding protein family 5  38.08 
 
 
535 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  37.12 
 
 
550 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  33.94 
 
 
544 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  34.84 
 
 
541 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  34.44 
 
 
535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  37.8 
 
 
536 aa  307  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  32.34 
 
 
530 aa  295  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  33.08 
 
 
532 aa  286  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2438  extracellular solute-binding protein  31.12 
 
 
526 aa  286  5.999999999999999e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  31.95 
 
 
530 aa  286  7e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3591  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  32.39 
 
 
564 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.018176 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3340  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  32.39 
 
 
564 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0333  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 
528 aa  285  2.0000000000000002e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.31964  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  35.5 
 
 
545 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  36 
 
 
555 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1624  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  32.57 
 
 
564 aa  282  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00452052  normal  0.135982 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  36.16 
 
 
558 aa  282  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2601  extracellular solute-binding protein family 5  34.17 
 
 
538 aa  282  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  34.59 
 
 
537 aa  281  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B15  oligopeptide ABC transporter OppAIV  32.48 
 
 
530 aa  280  5e-74  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.470524  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0756  extracellular solute-binding protein family 5  32.25 
 
 
549 aa  280  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  35.8 
 
 
543 aa  280  6e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  33.2 
 
 
547 aa  280  6e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1612  extracellular solute-binding protein family 5  33.21 
 
 
549 aa  279  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 
532 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  33.73 
 
 
560 aa  278  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2242  extracellular solute-binding protein  34.11 
 
 
564 aa  276  6e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3850  extracellular solute-binding protein family 5  32.23 
 
 
522 aa  276  7e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3694  oligopeptide-binding protein OppA  31.86 
 
 
564 aa  276  9e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.308453  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 
549 aa  275  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  34.14 
 
 
543 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  33.09 
 
 
526 aa  273  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  34.54 
 
 
545 aa  273  8.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  33.94 
 
 
543 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  33.94 
 
 
543 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  33.94 
 
 
543 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  33.94 
 
 
543 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  32.32 
 
 
545 aa  270  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  33.72 
 
 
537 aa  269  8e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  33.78 
 
 
537 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  33.78 
 
 
537 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  33.78 
 
 
537 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  31.85 
 
 
547 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  33.78 
 
 
537 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  33.78 
 
 
537 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1735  extracellular solute-binding protein family 5  32.93 
 
 
538 aa  269  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  33.78 
 
 
537 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 
544 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  33.78 
 
 
537 aa  268  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  32.63 
 
 
532 aa  268  2e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  34.93 
 
 
533 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1982  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 
543 aa  266  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.17175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2437  extracellular solute-binding protein  31.24 
 
 
554 aa  267  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  32.41 
 
 
526 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0115  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  33.48 
 
 
536 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  33 
 
 
538 aa  266  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2389  murein tripeptide ABC transporter periplasmic murein peptide-binding protein  33 
 
 
538 aa  266  8e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536818  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  33 
 
 
538 aa  266  8e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0865  extracellular solute-binding protein  31.27 
 
 
544 aa  266  8e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4730  extracellular solute-binding protein  32.97 
 
 
537 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  34 
 
 
537 aa  265  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2611  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 
544 aa  265  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.502409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  33.99 
 
 
533 aa  265  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2219  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.09 
 
 
550 aa  264  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5413  4-phytase  33.26 
 
 
537 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  33.13 
 
 
545 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  30.78 
 
 
526 aa  263  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  33.13 
 
 
545 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5318  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 
537 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177529  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5542  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 
537 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.390888  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  33.13 
 
 
525 aa  263  6e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.12 
 
 
558 aa  263  8e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4866  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 
537 aa  263  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  32.12 
 
 
558 aa  262  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0623  4-phytase  31.88 
 
 
552 aa  262  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000146122  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0546  4-phytase  31.88 
 
 
552 aa  262  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633185  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3263  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 
537 aa  262  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35798  normal  0.0152453 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  32.12 
 
 
543 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.12 
 
 
543 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  32.12 
 
 
543 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  32.06 
 
 
545 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>