More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0267 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0267  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
538 aa  1109    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  45.07 
 
 
534 aa  479  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  43.13 
 
 
535 aa  456  1e-127  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2238  extracellular solute-binding protein family 5  42.67 
 
 
534 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00707838  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1602  extracellular solute-binding protein family 5  45.21 
 
 
534 aa  443  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1590  extracellular solute-binding protein family 5  44.79 
 
 
530 aa  440  9.999999999999999e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  41.48 
 
 
541 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  40.53 
 
 
538 aa  435  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0728  extracellular solute-binding protein family 5  43.95 
 
 
535 aa  428  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  41.2 
 
 
542 aa  424  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0603  extracellular solute-binding protein family 5  42.88 
 
 
534 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0586  extracellular solute-binding protein family 5  39.59 
 
 
544 aa  414  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  40.19 
 
 
533 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  40.74 
 
 
531 aa  397  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2170  extracellular solute-binding protein family 5  40.5 
 
 
535 aa  391  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  36.87 
 
 
552 aa  385  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  39.69 
 
 
535 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1803  extracellular solute-binding protein family 5  37.52 
 
 
537 aa  358  1.9999999999999998e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2024  extracellular solute-binding protein family 5  36.85 
 
 
536 aa  347  2e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000427312  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  32.85 
 
 
550 aa  320  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  34.67 
 
 
541 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  33.39 
 
 
545 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.32 
 
 
543 aa  312  7.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  37.4 
 
 
555 aa  311  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  38.31 
 
 
558 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  36.08 
 
 
536 aa  306  8.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  35.58 
 
 
545 aa  299  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  35.58 
 
 
545 aa  298  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  36.21 
 
 
545 aa  297  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  37.24 
 
 
554 aa  295  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  36.06 
 
 
525 aa  295  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  36.4 
 
 
543 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  36.4 
 
 
543 aa  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  36.4 
 
 
543 aa  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  36.4 
 
 
543 aa  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  36.4 
 
 
543 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  35.49 
 
 
556 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  35.73 
 
 
533 aa  286  8e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  34.58 
 
 
556 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4505  extracellular solute-binding protein  32.38 
 
 
538 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.347947 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  35.7 
 
 
544 aa  284  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 
547 aa  283  6.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0115  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  32.51 
 
 
536 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  34.2 
 
 
526 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  34.38 
 
 
559 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  35.97 
 
 
561 aa  282  1e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  33.76 
 
 
526 aa  279  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5413  4-phytase  32.3 
 
 
537 aa  279  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  33.01 
 
 
541 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2601  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 
538 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4866  extracellular solute-binding protein  32.51 
 
 
537 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4730  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 
537 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3263  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 
537 aa  277  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35798  normal  0.0152453 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5318  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 
537 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177529  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5542  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 
537 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.390888  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  33.2 
 
 
543 aa  276  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  32.43 
 
 
537 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  32.09 
 
 
560 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  32.43 
 
 
537 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  32.24 
 
 
537 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2219  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.83 
 
 
550 aa  274  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  32.24 
 
 
537 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  33.54 
 
 
543 aa  273  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  33.33 
 
 
558 aa  272  9e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  32.05 
 
 
537 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  32.05 
 
 
537 aa  272  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  32.05 
 
 
537 aa  272  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 
537 aa  272  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  32.05 
 
 
537 aa  272  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  32.05 
 
 
537 aa  272  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  32.05 
 
 
537 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  33.33 
 
 
543 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  31.85 
 
 
537 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  32.62 
 
 
545 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  33.33 
 
 
558 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  33.33 
 
 
543 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  33.33 
 
 
543 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  33.33 
 
 
543 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
558 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2286  extracellular solute-binding protein family 5  33.67 
 
 
545 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  32.05 
 
 
537 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003657  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  32.82 
 
 
536 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  32.52 
 
 
547 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  32.92 
 
 
545 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0757  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.55 
 
 
538 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  33.59 
 
 
549 aa  269  8e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  33.12 
 
 
558 aa  269  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  32.5 
 
 
538 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2611  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 
544 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.502409 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  31.85 
 
 
537 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2389  murein tripeptide ABC transporter periplasmic murein peptide-binding protein  33.74 
 
 
538 aa  268  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536818  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0351  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.13 
 
 
554 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1253  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.93 
 
 
554 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  33.74 
 
 
538 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  31.96 
 
 
544 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1534  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.13 
 
 
554 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1724  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.13 
 
 
554 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532344  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3019  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.13 
 
 
554 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2903  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.13 
 
 
554 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0385  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.13 
 
 
554 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.918509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>