More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0587 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2238  extracellular solute-binding protein family 5  59.51 
 
 
534 aa  678    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00707838  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  57.68 
 
 
535 aa  655    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
534 aa  1108    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  60.15 
 
 
542 aa  665    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0586  extracellular solute-binding protein family 5  56.03 
 
 
544 aa  634  1e-180  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0603  extracellular solute-binding protein family 5  55.6 
 
 
534 aa  593  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1602  extracellular solute-binding protein family 5  52.99 
 
 
534 aa  568  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1590  extracellular solute-binding protein family 5  52.7 
 
 
530 aa  561  1e-158  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1803  extracellular solute-binding protein family 5  50 
 
 
537 aa  551  1e-155  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  49.81 
 
 
533 aa  541  9.999999999999999e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  48.69 
 
 
531 aa  523  1e-147  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0267  extracellular solute-binding protein family 5  45.07 
 
 
538 aa  479  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2024  extracellular solute-binding protein family 5  45.59 
 
 
536 aa  476  1e-133  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000427312  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  44.73 
 
 
541 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  43.93 
 
 
535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2170  extracellular solute-binding protein family 5  46.69 
 
 
535 aa  449  1e-125  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  44.63 
 
 
538 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  40.61 
 
 
552 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  37.72 
 
 
541 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0728  extracellular solute-binding protein family 5  37.5 
 
 
535 aa  354  2.9999999999999997e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  35.73 
 
 
545 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  36.45 
 
 
550 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  34.78 
 
 
544 aa  329  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  36.99 
 
 
532 aa  317  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  37.99 
 
 
558 aa  316  5e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  36.2 
 
 
532 aa  316  7e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  37.4 
 
 
543 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  37.6 
 
 
543 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  37.6 
 
 
543 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  37.6 
 
 
543 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.36 
 
 
543 aa  315  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  37.6 
 
 
543 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  35.98 
 
 
547 aa  313  5.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  37.85 
 
 
544 aa  310  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  35.19 
 
 
560 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  37.06 
 
 
537 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  37.06 
 
 
537 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  37.06 
 
 
537 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  37.06 
 
 
537 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  37.06 
 
 
537 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  37.06 
 
 
537 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  37.06 
 
 
537 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  37.06 
 
 
537 aa  307  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  36.57 
 
 
545 aa  306  7e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  35.46 
 
 
536 aa  306  9.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  35.87 
 
 
558 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  35.67 
 
 
558 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  36.02 
 
 
537 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  36.85 
 
 
537 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  36.02 
 
 
537 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  35.67 
 
 
558 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  35.82 
 
 
537 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  35.67 
 
 
558 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  35.67 
 
 
543 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  35.67 
 
 
543 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  35.82 
 
 
537 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  35.67 
 
 
543 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  35.67 
 
 
543 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3263  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 
537 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35798  normal  0.0152453 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  32.59 
 
 
530 aa  301  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  34.96 
 
 
545 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  35.61 
 
 
537 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  37.2 
 
 
549 aa  300  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.96 
 
 
545 aa  300  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  34.96 
 
 
525 aa  300  5e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  36.51 
 
 
555 aa  300  6e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  35.16 
 
 
556 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  35.27 
 
 
543 aa  298  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  33.52 
 
 
535 aa  298  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2611  extracellular solute-binding protein  35.61 
 
 
544 aa  298  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.502409 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2601  extracellular solute-binding protein family 5  34.37 
 
 
538 aa  298  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  37.4 
 
 
533 aa  298  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  35.08 
 
 
547 aa  297  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  33.59 
 
 
556 aa  297  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1735  extracellular solute-binding protein family 5  34.64 
 
 
538 aa  296  7e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2148  extracellular solute-binding protein  36.65 
 
 
538 aa  296  9e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0115  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  35.53 
 
 
536 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  35.64 
 
 
533 aa  294  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4866  extracellular solute-binding protein  35.15 
 
 
537 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  34.55 
 
 
549 aa  295  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  35.57 
 
 
545 aa  294  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5413  4-phytase  35.09 
 
 
537 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  35.88 
 
 
539 aa  293  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  36.24 
 
 
526 aa  293  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  36.76 
 
 
526 aa  292  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  35.74 
 
 
554 aa  292  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 
545 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4730  extracellular solute-binding protein  34.8 
 
 
537 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2219  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.8 
 
 
550 aa  291  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5318  extracellular solute-binding protein  34.58 
 
 
537 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177529  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5542  extracellular solute-binding protein  34.58 
 
 
537 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.390888  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  34.72 
 
 
530 aa  290  4e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4505  extracellular solute-binding protein  35.93 
 
 
538 aa  289  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.347947 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  34.98 
 
 
538 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2389  murein tripeptide ABC transporter periplasmic murein peptide-binding protein  34.98 
 
 
538 aa  288  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536818  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  34.98 
 
 
538 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2286  extracellular solute-binding protein family 5  35.92 
 
 
545 aa  288  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 
539 aa  287  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003657  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  36.99 
 
 
536 aa  286  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  33.79 
 
 
542 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>