More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2435 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
549 aa  1130    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2438  extracellular solute-binding protein  49.52 
 
 
526 aa  520  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  41.14 
 
 
544 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1982  extracellular solute-binding protein  43.44 
 
 
543 aa  421  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.17175 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  40.19 
 
 
554 aa  396  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  40.59 
 
 
543 aa  396  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  39.59 
 
 
558 aa  391  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2027  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  37.34 
 
 
555 aa  386  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.197641  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  39.63 
 
 
556 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  39.44 
 
 
556 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  37.52 
 
 
555 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  39.2 
 
 
545 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  38.88 
 
 
536 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2437  extracellular solute-binding protein  42.24 
 
 
554 aa  365  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  38.56 
 
 
547 aa  365  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.59 
 
 
558 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  37.41 
 
 
543 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.41 
 
 
543 aa  361  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  37.41 
 
 
543 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.41 
 
 
543 aa  361  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.41 
 
 
558 aa  362  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  37.41 
 
 
558 aa  362  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  37.41 
 
 
558 aa  361  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.41 
 
 
543 aa  361  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  39.24 
 
 
543 aa  360  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  39.24 
 
 
543 aa  359  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  39.24 
 
 
543 aa  359  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  39.24 
 
 
543 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  36.33 
 
 
545 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.07 
 
 
545 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  37.7 
 
 
525 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  39.03 
 
 
543 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  37.4 
 
 
547 aa  355  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  37.23 
 
 
544 aa  354  2e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  38.82 
 
 
545 aa  353  4e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  35.74 
 
 
535 aa  348  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  35.6 
 
 
561 aa  345  8.999999999999999e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  38.14 
 
 
560 aa  343  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  37.35 
 
 
533 aa  340  4e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0020  extracellular solute-binding protein  33.93 
 
 
558 aa  339  5.9999999999999996e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  35.7 
 
 
542 aa  336  7e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2286  extracellular solute-binding protein family 5  38.04 
 
 
545 aa  334  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  34.42 
 
 
541 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  37.42 
 
 
541 aa  332  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  36.22 
 
 
526 aa  330  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  34.97 
 
 
545 aa  329  8e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  36.42 
 
 
526 aa  329  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  37.65 
 
 
545 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  36.51 
 
 
559 aa  322  8e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1735  extracellular solute-binding protein family 5  37.21 
 
 
538 aa  322  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2601  extracellular solute-binding protein family 5  37.34 
 
 
538 aa  321  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2611  extracellular solute-binding protein  37.55 
 
 
544 aa  319  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.502409 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  36.85 
 
 
537 aa  317  5e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.526776 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  36.85 
 
 
537 aa  316  8e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  36.85 
 
 
537 aa  316  8e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  36.85 
 
 
537 aa  316  8e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  36.85 
 
 
537 aa  316  8e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  36.85 
 
 
537 aa  316  8e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  36.85 
 
 
537 aa  316  8e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  36.85 
 
 
537 aa  316  9e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  36.85 
 
 
537 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  32.98 
 
 
552 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  35.59 
 
 
537 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  37.01 
 
 
538 aa  311  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2389  murein tripeptide ABC transporter periplasmic murein peptide-binding protein  37.01 
 
 
538 aa  310  4e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536818  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  37.01 
 
 
538 aa  310  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2319  extracellular solute-binding protein family 5  35.83 
 
 
538 aa  310  4e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  35.19 
 
 
537 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  34.99 
 
 
537 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  34.87 
 
 
532 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  34.99 
 
 
537 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  34.81 
 
 
539 aa  307  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  36.06 
 
 
525 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  35.19 
 
 
537 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  34.71 
 
 
533 aa  306  6e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  34.58 
 
 
535 aa  306  7e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  35.65 
 
 
528 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  35.11 
 
 
532 aa  304  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1590  extracellular solute-binding protein family 5  34.97 
 
 
530 aa  303  6.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2148  extracellular solute-binding protein  34.42 
 
 
538 aa  303  6.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 
526 aa  303  7.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  32.71 
 
 
543 aa  301  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  33.09 
 
 
541 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0333  extracellular solute-binding protein  34.51 
 
 
528 aa  299  7e-80  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.31964  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  36.65 
 
 
529 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2238  extracellular solute-binding protein family 5  34.96 
 
 
534 aa  296  7e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00707838  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  35.21 
 
 
525 aa  296  8e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  34.55 
 
 
534 aa  295  1e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  35.02 
 
 
525 aa  294  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0145  4-phytase  40.35 
 
 
619 aa  294  3e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.331033  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0865  extracellular solute-binding protein  33.27 
 
 
544 aa  293  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1328  extracellular solute-binding protein  34.99 
 
 
534 aa  293  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  37.16 
 
 
529 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  34.95 
 
 
539 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1569  extracellular solute-binding protein  34.99 
 
 
534 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199164  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  31.14 
 
 
538 aa  290  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  36.96 
 
 
529 aa  289  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B15  oligopeptide ABC transporter OppAIV  34.63 
 
 
530 aa  288  1e-76  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.470524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  34.14 
 
 
537 aa  288  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2654  extracellular solute-binding protein family 5  31.63 
 
 
544 aa  287  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.411058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>