More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2389 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  70.58 
 
 		 537 aa  803    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  70.58 
 
 		 537 aa  803    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  70.58 
 
 		 537 aa  801    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  74.31 
 
 		 560 aa  853    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  70.58 
 
 		 537 aa  803    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2319  extracellular solute-binding protein family 5  74.91 
 
 		 538 aa  835    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  70.2 
 
 		 537 aa  795    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2601  extracellular solute-binding protein family 5  75.65 
 
 		 538 aa  855    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  70.02 
 
 		 537 aa  794    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 538 aa  1108    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  99.81 
 
 		 538 aa  1108    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  70.58 
 
 		 537 aa  803    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  70.39 
 
 		 537 aa  800    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2389  murein tripeptide ABC transporter periplasmic murein peptide-binding protein  100 
 
 		 538 aa  1108    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  70.02 
 
 		 537 aa  795    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1735  extracellular solute-binding protein family 5  74.67 
 
 		 538 aa  835    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2611  extracellular solute-binding protein  80.37 
 
 		 544 aa  916    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.502409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  70.58 
 
 		 537 aa  803    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  70.2 
 
 		 537 aa  795    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  70.2 
 
 		 537 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  69.7 
 
 		 537 aa  797    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2148  extracellular solute-binding protein  69.79 
 
 		 538 aa  774    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  70.58 
 
 		 537 aa  803    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  51.59 
 
 		 536 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  50.38 
 
 		 555 aa  556  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  50.29 
 
 		 554 aa  543  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  48.5 
 
 		 543 aa  536  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  49.7 
 
 		 558 aa  534  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  48.97 
 
 		 544 aa  521  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  49.07 
 
 		 558 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  48.88 
 
 		 558 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  48.88 
 
 		 543 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  48.88 
 
 		 558 aa  514  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  48.88 
 
 		 543 aa  514  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  48.88 
 
 		 558 aa  514  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  48.88 
 
 		 543 aa  514  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  48.88 
 
 		 543 aa  514  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  48.88 
 
 		 543 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  48.41 
 
 		 545 aa  509  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  48.04 
 
 		 545 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  47.84 
 
 		 545 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  48.84 
 
 		 543 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  48.28 
 
 		 525 aa  503  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  48.84 
 
 		 543 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  48.84 
 
 		 543 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  48.84 
 
 		 543 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  48.84 
 
 		 543 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  46.36 
 
 		 547 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  47.5 
 
 		 541 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  47.05 
 
 		 545 aa  485  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  45.9 
 
 		 556 aa  487  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  46.92 
 
 		 547 aa  484  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  47.02 
 
 		 545 aa  482  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  46.11 
 
 		 559 aa  479  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  45.15 
 
 		 556 aa  478  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2286  extracellular solute-binding protein family 5  47.41 
 
 		 545 aa  474  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  43.47 
 
 		 543 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2654  extracellular solute-binding protein family 5  43.31 
 
 		 544 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.411058  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  44.53 
 
 		 533 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  43.05 
 
 		 539 aa  443  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  42.75 
 
 		 539 aa  442  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  43.14 
 
 		 537 aa  443  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  42.64 
 
 		 542 aa  438  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  40.73 
 
 		 561 aa  429  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  42.29 
 
 		 537 aa  415  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4730  extracellular solute-binding protein  40.19 
 
 		 537 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0020  extracellular solute-binding protein  40.04 
 
 		 558 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3263  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 537 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35798  normal  0.0152453 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5318  extracellular solute-binding protein  40.19 
 
 		 537 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177529  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5542  extracellular solute-binding protein  40.19 
 
 		 537 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.390888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0115  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  39.7 
 
 		 536 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003657  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  42.07 
 
 		 536 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5413  4-phytase  40.15 
 
 		 537 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4866  extracellular solute-binding protein  40.15 
 
 		 537 aa  399  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02892  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  42.47 
 
 		 535 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.922865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0680  extracellular solute-binding protein family 5  42.47 
 
 		 535 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4331  putative binding protein  42.28 
 
 		 535 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02842  hypothetical protein  42.47 
 
 		 535 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.81173  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3198  putative binding protein  42.47 
 
 		 535 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0677  putative binding protein  42.47 
 
 		 535 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3311  putative binding protein  42.28 
 
 		 535 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43332  normal  0.120975 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1328  extracellular solute-binding protein  38.85 
 
 		 534 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1569  extracellular solute-binding protein  38.85 
 
 		 534 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199164  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4505  extracellular solute-binding protein  37.2 
 
 		 538 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.347947 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2219  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  38.29 
 
 		 550 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4438  extracellular solute-binding protein family 5  36.64 
 
 		 538 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.829261 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0351  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  38.58 
 
 		 554 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1253  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  38.39 
 
 		 554 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1534  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  38.58 
 
 		 554 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1724  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  38.58 
 
 		 554 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532344  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3019  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  38.58 
 
 		 554 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2903  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  38.58 
 
 		 554 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0385  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  38.58 
 
 		 554 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.918509  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  37.43 
 
 		 526 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0757  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  36.26 
 
 		 538 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  38.7 
 
 		 526 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  38.76 
 
 		 532 aa  356  5e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  36.75 
 
 		 532 aa  336  7.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  37.21 
 
 		 528 aa  333  3e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  37.35 
 
 		 549 aa  333  7.000000000000001e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>