More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1448 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  57.68 
 
 
534 aa  655    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2238  extracellular solute-binding protein family 5  61.38 
 
 
534 aa  694    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00707838  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  62.12 
 
 
542 aa  684    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
535 aa  1111    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1590  extracellular solute-binding protein family 5  55.45 
 
 
530 aa  589  1e-167  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1803  extracellular solute-binding protein family 5  52.59 
 
 
537 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0603  extracellular solute-binding protein family 5  51.76 
 
 
534 aa  565  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1602  extracellular solute-binding protein family 5  51.25 
 
 
534 aa  544  1e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0586  extracellular solute-binding protein family 5  48.88 
 
 
544 aa  532  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  49.81 
 
 
533 aa  529  1e-149  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  49.05 
 
 
538 aa  519  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  47.1 
 
 
531 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  47.03 
 
 
541 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2170  extracellular solute-binding protein family 5  46.8 
 
 
535 aa  476  1e-133  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  44.69 
 
 
535 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0267  extracellular solute-binding protein family 5  43.13 
 
 
538 aa  456  1e-127  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  44.32 
 
 
552 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2024  extracellular solute-binding protein family 5  43.07 
 
 
536 aa  444  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000427312  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  38.48 
 
 
550 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  38.1 
 
 
545 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0728  extracellular solute-binding protein family 5  38.21 
 
 
535 aa  366  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  36.33 
 
 
541 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  36.89 
 
 
544 aa  324  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  34.41 
 
 
544 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  35.69 
 
 
536 aa  320  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  32.55 
 
 
535 aa  316  8e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  37.91 
 
 
558 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  35.45 
 
 
545 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.51 
 
 
543 aa  310  5.9999999999999995e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  34.21 
 
 
530 aa  309  6.999999999999999e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  35.86 
 
 
532 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  35.19 
 
 
532 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  35.73 
 
 
547 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  34.99 
 
 
543 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.99 
 
 
543 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  34.99 
 
 
558 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.99 
 
 
558 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.99 
 
 
543 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  34.99 
 
 
543 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.99 
 
 
558 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  34.58 
 
 
549 aa  306  8.000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  35.39 
 
 
543 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  35.39 
 
 
543 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  35.39 
 
 
543 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  35.39 
 
 
543 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  34.79 
 
 
558 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  36.5 
 
 
537 aa  305  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.79 
 
 
543 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 
525 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  35.19 
 
 
543 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  33.83 
 
 
556 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  33.64 
 
 
556 aa  301  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  36.01 
 
 
539 aa  301  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1328  extracellular solute-binding protein  38.27 
 
 
534 aa  298  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 
545 aa  297  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  35.21 
 
 
533 aa  297  4e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.89 
 
 
545 aa  296  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1569  extracellular solute-binding protein  38.27 
 
 
534 aa  296  5e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199164  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  35.37 
 
 
529 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  33.67 
 
 
525 aa  295  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  34.64 
 
 
542 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  36.8 
 
 
549 aa  295  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  33.54 
 
 
547 aa  295  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  35.57 
 
 
529 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  34.91 
 
 
554 aa  294  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  35.39 
 
 
539 aa  292  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  33.86 
 
 
545 aa  290  6e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  35.7 
 
 
526 aa  289  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  32.78 
 
 
530 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  34.18 
 
 
537 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  33.4 
 
 
543 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  34.96 
 
 
529 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  34.25 
 
 
537 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  34.25 
 
 
537 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  34.25 
 
 
537 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  34.05 
 
 
537 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  33.86 
 
 
537 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 
537 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  34.25 
 
 
537 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  33.86 
 
 
537 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  34.25 
 
 
537 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  34.25 
 
 
537 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  34.05 
 
 
537 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0333  extracellular solute-binding protein  34.76 
 
 
528 aa  284  3.0000000000000004e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.31964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  34.5 
 
 
555 aa  283  8.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1982  extracellular solute-binding protein  31.39 
 
 
543 aa  282  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.17175 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  33.14 
 
 
537 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  34.05 
 
 
537 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0115  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  33.12 
 
 
536 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  32.1 
 
 
533 aa  281  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  34.01 
 
 
526 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2438  extracellular solute-binding protein  32.56 
 
 
526 aa  280  6e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B15  oligopeptide ABC transporter OppAIV  34.33 
 
 
530 aa  279  7e-74  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.470524  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3263  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 
537 aa  279  8e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35798  normal  0.0152453 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0351  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.58 
 
 
554 aa  279  9e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1534  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.58 
 
 
554 aa  279  9e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1724  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.58 
 
 
554 aa  279  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532344  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3019  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.58 
 
 
554 aa  279  9e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2903  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.58 
 
 
554 aa  279  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0385  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.58 
 
 
554 aa  279  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.918509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>