More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2769 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
507 aa  1032    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0459  extracellular solute-binding protein  74.16 
 
 
504 aa  755    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435025  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  48.28 
 
 
507 aa  441  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  41.96 
 
 
505 aa  383  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  36.71 
 
 
492 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.42 
 
 
492 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  37.03 
 
 
508 aa  305  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.19 
 
 
479 aa  302  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26350  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  36.72 
 
 
526 aa  300  4e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228589 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  35.27 
 
 
492 aa  300  6e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  34.59 
 
 
489 aa  286  9e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  34.94 
 
 
509 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  35.28 
 
 
493 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  34.59 
 
 
508 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  33.26 
 
 
494 aa  267  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4354  extracellular solute-binding protein family 5  34.3 
 
 
497 aa  251  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148655  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  32.69 
 
 
506 aa  247  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4355  extracellular solute-binding protein family 5  34.17 
 
 
495 aa  242  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0355555  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0816  extracellular solute-binding protein family 5  34.84 
 
 
496 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0887  extracellular solute-binding protein  34.84 
 
 
496 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545524  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6472  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  33.63 
 
 
495 aa  240  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149439  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3049  extracellular solute-binding protein family 5  31.72 
 
 
503 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0139  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
502 aa  234  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.184027  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 
495 aa  233  9e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0919  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  30.43 
 
 
539 aa  225  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.654123  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  29.89 
 
 
501 aa  220  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5441  extracellular solute-binding protein  32.03 
 
 
497 aa  213  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.876365  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  29.17 
 
 
499 aa  207  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  32.91 
 
 
522 aa  205  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1058  extracellular solute-binding protein  30.55 
 
 
563 aa  203  6e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  31.26 
 
 
503 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.72 
 
 
520 aa  183  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  28.98 
 
 
505 aa  182  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1196  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  29.03 
 
 
488 aa  172  9e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.419054  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.5 
 
 
509 aa  171  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  31.38 
 
 
512 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  31.54 
 
 
512 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  31.54 
 
 
512 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  29.97 
 
 
502 aa  169  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  31.54 
 
 
512 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 
510 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 
515 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.72 
 
 
510 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  31.03 
 
 
512 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  28.51 
 
 
529 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.97 
 
 
540 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  33.83 
 
 
538 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  32.9 
 
 
544 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1084  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  31.61 
 
 
539 aa  162  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 
529 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  27.7 
 
 
529 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.9 
 
 
521 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.9 
 
 
521 aa  159  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 
521 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  28.9 
 
 
521 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.67 
 
 
521 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30.13 
 
 
512 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  27.57 
 
 
558 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 
531 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30.13 
 
 
512 aa  157  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.97 
 
 
546 aa  156  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  30.37 
 
 
523 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  31.18 
 
 
514 aa  156  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.87 
 
 
512 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  27.71 
 
 
526 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.87 
 
 
512 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.85 
 
 
516 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  32.06 
 
 
538 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  30.33 
 
 
520 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  29.61 
 
 
512 aa  154  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  30.62 
 
 
526 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.61 
 
 
512 aa  154  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  29.61 
 
 
512 aa  154  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 
512 aa  154  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 
528 aa  154  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 
510 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  30.81 
 
 
512 aa  153  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  30.7 
 
 
495 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 
520 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 
505 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 
520 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  27.07 
 
 
522 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  29.49 
 
 
514 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.39 
 
 
542 aa  152  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  28.97 
 
 
523 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.89 
 
 
505 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  31.3 
 
 
517 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 
520 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 
520 aa  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  28.09 
 
 
533 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  31.45 
 
 
519 aa  151  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 
538 aa  151  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  29.1 
 
 
520 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  29.07 
 
 
517 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.47 
 
 
512 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 
538 aa  150  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.75 
 
 
517 aa  150  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  27.48 
 
 
525 aa  150  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  30.52 
 
 
493 aa  149  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.73 
 
 
520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>