More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2587 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 502 aa  1021    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  37.01 
 
 		 505 aa  314  2.9999999999999996e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  35.44 
 
 		 508 aa  272  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3804  extracellular solute-binding protein  33.07 
 
 		 501 aa  265  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000726853  hitchhiker  0.0000406829 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  34.15 
 
 		 521 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.15 
 
 		 521 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  34.15 
 
 		 521 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  31.92 
 
 		 510 aa  257  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 		 521 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  33.94 
 
 		 521 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.76 
 
 		 510 aa  253  6e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  30.49 
 
 		 534 aa  246  9e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 		 515 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  34.26 
 
 		 512 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 512 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 512 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 512 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  31.71 
 
 		 535 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.87 
 
 		 538 aa  236  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  32.32 
 
 		 534 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  31.45 
 
 		 516 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  31.71 
 
 		 514 aa  230  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  33.21 
 
 		 520 aa  230  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  30.27 
 
 		 495 aa  229  8e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  31.24 
 
 		 520 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  33.12 
 
 		 519 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  31.24 
 
 		 520 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  31.24 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  34.09 
 
 		 514 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  32.84 
 
 		 512 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  33.14 
 
 		 546 aa  227  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  33.67 
 
 		 528 aa  227  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  32.63 
 
 		 512 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  33.05 
 
 		 512 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  32.32 
 
 		 517 aa  227  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  31 
 
 		 510 aa  226  8e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  31.15 
 
 		 516 aa  226  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  32.42 
 
 		 512 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 		 509 aa  225  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  32.84 
 
 		 512 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  32.84 
 
 		 512 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  32.42 
 
 		 512 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  32.42 
 
 		 512 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  32.84 
 
 		 512 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  32.84 
 
 		 512 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  31.5 
 
 		 533 aa  225  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  32.42 
 
 		 493 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  32.42 
 
 		 512 aa  224  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  33.26 
 
 		 531 aa  224  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  32.42 
 
 		 512 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  31.71 
 
 		 514 aa  224  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  32.42 
 
 		 512 aa  224  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  31.02 
 
 		 517 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.43 
 
 		 520 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  30.63 
 
 		 520 aa  223  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 520 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 520 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 		 520 aa  223  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  30.82 
 
 		 529 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  32.74 
 
 		 509 aa  222  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  28.05 
 
 		 541 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  31.84 
 
 		 521 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  30.4 
 
 		 520 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  30.85 
 
 		 538 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  31.01 
 
 		 520 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  31.62 
 
 		 517 aa  219  7e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  31.25 
 
 		 522 aa  219  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.36 
 
 		 508 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  29.58 
 
 		 529 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 528 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  31.26 
 
 		 522 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  30.31 
 
 		 532 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  31.88 
 
 		 516 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  30.57 
 
 		 517 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 		 517 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  32.73 
 
 		 533 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  31.07 
 
 		 516 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 		 520 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0232  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 		 517 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  30.9 
 
 		 512 aa  214  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.98 
 
 		 517 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 510 aa  213  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  28.96 
 
 		 531 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 		 539 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 		 519 aa  213  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  32.19 
 
 		 531 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 532 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  31.3 
 
 		 515 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 		 521 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  30.18 
 
 		 520 aa  212  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 512 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  30.63 
 
 		 529 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1408  extracellular solute-binding protein  31.45 
 
 		 518 aa  211  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00741999  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 		 522 aa  210  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.79 
 
 		 528 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 535 aa  210  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 515 aa  210  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 		 531 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 511 aa  209  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  28.51 
 
 		 532 aa  209  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>