More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1313 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 493 aa  1006    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  58.8 
 
 		 494 aa  584  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  58.49 
 
 		 489 aa  580  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  58.26 
 
 		 492 aa  569  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  52.44 
 
 		 492 aa  537  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  53.12 
 
 		 479 aa  532  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  52.66 
 
 		 492 aa  532  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  47.27 
 
 		 508 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  46.57 
 
 		 509 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  46.17 
 
 		 508 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  47.55 
 
 		 495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0139  extracellular solute-binding protein  46.61 
 
 		 502 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.184027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0816  extracellular solute-binding protein family 5  47.21 
 
 		 496 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0887  extracellular solute-binding protein  47.21 
 
 		 496 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5441  extracellular solute-binding protein  46.03 
 
 		 497 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.876365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4355  extracellular solute-binding protein family 5  46.86 
 
 		 495 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0355555  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4354  extracellular solute-binding protein family 5  45.92 
 
 		 497 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148655  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6472  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  45.26 
 
 		 495 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3049  extracellular solute-binding protein family 5  39.83 
 
 		 503 aa  349  8e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  38.74 
 
 		 501 aa  311  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  36.09 
 
 		 506 aa  299  8e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26350  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  35.41 
 
 		 526 aa  294  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228589 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  36.62 
 
 		 499 aa  292  7e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  34.86 
 
 		 507 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0459  extracellular solute-binding protein  36.18 
 
 		 504 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435025  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.54 
 
 		 507 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  32.99 
 
 		 522 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  31.5 
 
 		 505 aa  246  6.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  32.56 
 
 		 503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1058  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 563 aa  234  3e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0919  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  31.26 
 
 		 539 aa  232  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.654123  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  35.75 
 
 		 565 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  34.22 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.59 
 
 		 510 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  31.77 
 
 		 534 aa  217  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  32.33 
 
 		 495 aa  214  3.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.83 
 
 		 521 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 512 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  32.6 
 
 		 509 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 512 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 512 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.83 
 
 		 521 aa  212  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.83 
 
 		 521 aa  212  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.83 
 
 		 521 aa  212  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 521 aa  212  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  33.47 
 
 		 535 aa  210  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  32 
 
 		 541 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  32.92 
 
 		 528 aa  207  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  32.29 
 
 		 524 aa  205  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  33.87 
 
 		 523 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  30.49 
 
 		 522 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  29.53 
 
 		 528 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  30.66 
 
 		 505 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  29.25 
 
 		 524 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  30.35 
 
 		 509 aa  201  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.92 
 
 		 538 aa  200  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  32.39 
 
 		 524 aa  200  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  32.79 
 
 		 528 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 		 505 aa  200  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  27.96 
 
 		 519 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 		 538 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  31.52 
 
 		 531 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 544 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.43 
 
 		 535 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.43 
 
 		 535 aa  196  9e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  31.43 
 
 		 535 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  31.43 
 
 		 535 aa  196  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 530 aa  196  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.43 
 
 		 535 aa  196  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  31.43 
 
 		 535 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.43 
 
 		 535 aa  196  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  31.43 
 
 		 535 aa  196  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 515 aa  195  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  30.25 
 
 		 520 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  32.36 
 
 		 531 aa  194  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  30.02 
 
 		 535 aa  193  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  34.9 
 
 		 532 aa  193  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  31.24 
 
 		 532 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 542 aa  192  9e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  31.24 
 
 		 530 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  30.25 
 
 		 513 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.72 
 
 		 542 aa  192  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  31.12 
 
 		 545 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  30.04 
 
 		 513 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  30.8 
 
 		 535 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  30.53 
 
 		 535 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  30.53 
 
 		 535 aa  190  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  29.01 
 
 		 544 aa  190  4e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.53 
 
 		 535 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.99 
 
 		 505 aa  191  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  32.22 
 
 		 558 aa  190  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 532 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  30.58 
 
 		 531 aa  190  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  32.24 
 
 		 526 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  31.44 
 
 		 544 aa  190  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  30.35 
 
 		 544 aa  189  7e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.69 
 
 		 526 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.91 
 
 		 532 aa  189  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 510 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  33.16 
 
 		 516 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>