More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0919 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1058  extracellular solute-binding protein  60.91 
 
 
563 aa  658    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0919  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 
539 aa  1088    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.654123  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1196  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  35.33 
 
 
488 aa  276  7e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.419054  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26350  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  35.32 
 
 
526 aa  252  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228589 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 
494 aa  246  6e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  32.4 
 
 
501 aa  238  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  33.26 
 
 
508 aa  233  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  33.26 
 
 
509 aa  230  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  34.41 
 
 
506 aa  230  6e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6472  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  33.9 
 
 
495 aa  228  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149439  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  31.26 
 
 
507 aa  226  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  31.59 
 
 
493 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  30.62 
 
 
492 aa  222  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  32.1 
 
 
492 aa  219  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0191  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 
495 aa  218  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.82 
 
 
508 aa  218  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.13 
 
 
507 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  31.4 
 
 
505 aa  215  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0459  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 
504 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435025  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 
489 aa  211  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.79 
 
 
479 aa  209  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.79 
 
 
492 aa  209  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  28.66 
 
 
499 aa  209  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0887  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 
496 aa  208  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545524  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0816  extracellular solute-binding protein family 5  33.48 
 
 
496 aa  208  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3049  extracellular solute-binding protein family 5  30.75 
 
 
503 aa  206  9e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 
495 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4354  extracellular solute-binding protein family 5  29.36 
 
 
497 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148655  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4355  extracellular solute-binding protein family 5  31.95 
 
 
495 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0355555  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0139  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 
502 aa  192  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.184027  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5441  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 
497 aa  189  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.876365  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  30.49 
 
 
505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 
510 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.09 
 
 
510 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 
512 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 
512 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 
512 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  29.07 
 
 
512 aa  160  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 
515 aa  160  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 
511 aa  158  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  28.44 
 
 
529 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  27.99 
 
 
529 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 
510 aa  154  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 
522 aa  152  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  30.09 
 
 
532 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 
517 aa  149  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  27.14 
 
 
531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  31.05 
 
 
533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 
529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 
516 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  27.78 
 
 
515 aa  148  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 
536 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.16 
 
 
505 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.82 
 
 
540 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 
519 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.59 
 
 
502 aa  145  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  26.83 
 
 
520 aa  143  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 
528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 
503 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 
534 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 
527 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2763  extracellular solute-binding protein family 5  29.78 
 
 
518 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  28.11 
 
 
558 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  25.58 
 
 
517 aa  139  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  26.08 
 
 
545 aa  138  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  27.7 
 
 
515 aa  137  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.33 
 
 
538 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 
526 aa  137  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.66 
 
 
525 aa  137  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  27.43 
 
 
503 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 
503 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  27.34 
 
 
509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  24.79 
 
 
495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 
544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
539 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3842  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 
568 aa  135  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450891  normal  0.108057 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.4 
 
 
535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  27.56 
 
 
560 aa  134  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  30.91 
 
 
631 aa  133  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.66 
 
 
525 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.68 
 
 
532 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.57 
 
 
546 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  25.7 
 
 
528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  26.44 
 
 
502 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 
498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 
530 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  25.86 
 
 
524 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 
508 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.62 
 
 
531 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 
516 aa  130  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 
525 aa  130  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 
505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 
510 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  26.55 
 
 
522 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  26.7 
 
 
527 aa  128  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
509 aa  128  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3787  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 
531 aa  128  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.216169  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
544 aa  128  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.26 
 
 
527 aa  127  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>