More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2761 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  82.56 
 
 
512 aa  838    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  67 
 
 
510 aa  674    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
515 aa  1049    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  82.56 
 
 
512 aa  838    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  82.56 
 
 
512 aa  838    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  87.1 
 
 
510 aa  887    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  60.71 
 
 
516 aa  613  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  55.75 
 
 
510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  56.1 
 
 
511 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  55.22 
 
 
523 aa  531  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  54.33 
 
 
512 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  36.8 
 
 
505 aa  281  3e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  31.97 
 
 
517 aa  253  6e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  34.09 
 
 
519 aa  249  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  31.85 
 
 
502 aa  246  6e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  34.1 
 
 
546 aa  240  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  32.27 
 
 
534 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  31.74 
 
 
540 aa  238  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  32.12 
 
 
520 aa  237  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  32.69 
 
 
538 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  31.55 
 
 
535 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.03 
 
 
538 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  33.12 
 
 
528 aa  228  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 
539 aa  225  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  33.26 
 
 
505 aa  224  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.75 
 
 
492 aa  223  9e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.75 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  32.7 
 
 
524 aa  222  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  31.73 
 
 
509 aa  221  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 
522 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  32.91 
 
 
492 aa  219  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  32.39 
 
 
532 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  31.95 
 
 
540 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 
500 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  32.9 
 
 
503 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.94 
 
 
521 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  32.69 
 
 
503 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.94 
 
 
521 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.94 
 
 
521 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.94 
 
 
521 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 
521 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  32.93 
 
 
523 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0816  extracellular solute-binding protein family 5  34.59 
 
 
496 aa  212  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  31.64 
 
 
541 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0887  extracellular solute-binding protein  34.59 
 
 
496 aa  212  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545524  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  33.86 
 
 
531 aa  210  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 
498 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  29.94 
 
 
495 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 
551 aa  208  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 
490 aa  208  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 
510 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  30.9 
 
 
502 aa  206  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  30.36 
 
 
503 aa  206  8e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  30.32 
 
 
502 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  32.49 
 
 
514 aa  206  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  29.9 
 
 
533 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  29.2 
 
 
534 aa  205  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3804  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 
501 aa  204  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000726853  hitchhiker  0.0000406829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.29 
 
 
505 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  30.48 
 
 
508 aa  204  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.49 
 
 
540 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.26 
 
 
508 aa  201  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5083  4-phytase  29.48 
 
 
495 aa  196  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.116329 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  29.96 
 
 
552 aa  196  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  29.98 
 
 
509 aa  196  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.91 
 
 
516 aa  195  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 
528 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  29.67 
 
 
520 aa  194  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 
519 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 
521 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 
534 aa  194  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  28.94 
 
 
524 aa  194  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 
516 aa  192  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  32.43 
 
 
529 aa  192  9e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  32.33 
 
 
509 aa  192  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 
529 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  32.68 
 
 
492 aa  192  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 
494 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  35.35 
 
 
506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.39 
 
 
520 aa  190  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 
493 aa  191  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.07 
 
 
513 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 
509 aa  190  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  30.25 
 
 
502 aa  189  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 
559 aa  189  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 
525 aa  189  9e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  29.62 
 
 
509 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  30.22 
 
 
508 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  29.18 
 
 
495 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  30.85 
 
 
529 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  31.05 
 
 
525 aa  188  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  29.01 
 
 
544 aa  188  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  27.91 
 
 
526 aa  187  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  30.27 
 
 
490 aa  187  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 
508 aa  187  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 
595 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  28.46 
 
 
524 aa  186  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  31.35 
 
 
556 aa  186  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  28.2 
 
 
516 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  30.83 
 
 
565 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>