More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3773 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  81.14 
 
 		 512 aa  822    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  81.14 
 
 		 512 aa  822    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  66.19 
 
 		 510 aa  665    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  81.14 
 
 		 512 aa  822    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 510 aa  1040    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  87.1 
 
 		 515 aa  889    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  60.67 
 
 		 516 aa  607  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  55.86 
 
 		 510 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  55.8 
 
 		 511 aa  565  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  54.03 
 
 		 523 aa  520  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  53.4 
 
 		 512 aa  507  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  35.14 
 
 		 505 aa  265  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  31.9 
 
 		 517 aa  249  7e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  34.56 
 
 		 519 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  32.69 
 
 		 540 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.86 
 
 		 520 aa  240  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  32.85 
 
 		 509 aa  237  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  30.61 
 
 		 502 aa  230  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 528 aa  230  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  32.16 
 
 		 546 aa  229  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.65 
 
 		 538 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 		 538 aa  226  9e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  32.08 
 
 		 534 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  31.27 
 
 		 535 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  32.05 
 
 		 524 aa  219  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 		 522 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  32.3 
 
 		 531 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  31.74 
 
 		 539 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  33.63 
 
 		 532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 		 540 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  31.81 
 
 		 500 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  30.56 
 
 		 534 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0816  extracellular solute-binding protein family 5  34.03 
 
 		 496 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0887  extracellular solute-binding protein  34.03 
 
 		 496 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.98 
 
 		 492 aa  211  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3804  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 		 501 aa  211  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000726853  hitchhiker  0.0000406829 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.98 
 
 		 479 aa  211  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  30.31 
 
 		 502 aa  209  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  29.75 
 
 		 495 aa  209  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 		 490 aa  209  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  31.61 
 
 		 503 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  31.22 
 
 		 541 aa  208  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 503 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  33.13 
 
 		 523 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 		 505 aa  207  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  32.42 
 
 		 529 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  29.7 
 
 		 533 aa  206  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  32.42 
 
 		 514 aa  204  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  29.05 
 
 		 502 aa  203  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  32.49 
 
 		 492 aa  203  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 		 510 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 498 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.43 
 
 		 540 aa  200  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.94 
 
 		 521 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.94 
 
 		 521 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.94 
 
 		 521 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  28.94 
 
 		 521 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 		 521 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.33 
 
 		 505 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  29.94 
 
 		 508 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  29.11 
 
 		 524 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 		 528 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 551 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 		 521 aa  197  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  30.43 
 
 		 503 aa  196  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4354  extracellular solute-binding protein family 5  32.56 
 
 		 497 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148655  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  29.82 
 
 		 502 aa  195  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  32.7 
 
 		 495 aa  195  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  29.79 
 
 		 552 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5083  4-phytase  29.61 
 
 		 495 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.116329 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  27.63 
 
 		 524 aa  194  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  31.63 
 
 		 528 aa  192  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.91 
 
 		 516 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 509 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  32.12 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  31.41 
 
 		 525 aa  191  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  32.49 
 
 		 492 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 516 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  32.29 
 
 		 494 aa  189  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  35.44 
 
 		 506 aa  188  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 		 595 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.08 
 
 		 520 aa  187  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.99 
 
 		 508 aa  187  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  29.06 
 
 		 520 aa  187  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  30.45 
 
 		 509 aa  186  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  31.53 
 
 		 534 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  29.59 
 
 		 490 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.46 
 
 		 542 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  29.71 
 
 		 495 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  29.3 
 
 		 537 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4211  extracellular solute-binding protein  29.77 
 
 		 504 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 		 529 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  25.76 
 
 		 552 aa  182  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 551 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 		 512 aa  182  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  31.25 
 
 		 509 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2148  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 538 aa  180  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 509 aa  180  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 493 aa  181  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 532 aa  180  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>