More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2497 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
528 aa  1077    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  85.69 
 
 
529 aa  909    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  59.68 
 
 
525 aa  594  1e-168  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  43.21 
 
 
595 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  41.03 
 
 
535 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  40.43 
 
 
534 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  41.09 
 
 
524 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  39.19 
 
 
565 aa  355  8.999999999999999e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  35.41 
 
 
541 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  33.65 
 
 
535 aa  286  7e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  33.46 
 
 
535 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  33.46 
 
 
535 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  33.46 
 
 
535 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  33.46 
 
 
535 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  33.46 
 
 
535 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  33.46 
 
 
535 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  33.27 
 
 
535 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  34.64 
 
 
530 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  33.27 
 
 
535 aa  283  5.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  33.02 
 
 
535 aa  283  6.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  34.96 
 
 
532 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  36.26 
 
 
545 aa  282  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  33.46 
 
 
535 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  33.27 
 
 
535 aa  281  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  35.1 
 
 
528 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  33.08 
 
 
526 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  33.08 
 
 
526 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  32.69 
 
 
535 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  33.08 
 
 
526 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  33.08 
 
 
526 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  32.64 
 
 
535 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  32.89 
 
 
526 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  33.27 
 
 
535 aa  276  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  33.27 
 
 
535 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  33.27 
 
 
535 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0216  extracellular solute-binding protein  35.65 
 
 
553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.923383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  33.98 
 
 
531 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 
531 aa  273  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  35.01 
 
 
566 aa  272  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0255  extracellular solute-binding protein  35.05 
 
 
554 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192685  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  33.01 
 
 
532 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0480  extracellular solute-binding protein family 5  32.32 
 
 
569 aa  269  8e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105843  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  32.28 
 
 
531 aa  267  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0658  extracellular solute-binding protein family 5  34.03 
 
 
577 aa  266  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  33.2 
 
 
547 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  32.76 
 
 
506 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  32.5 
 
 
556 aa  264  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  33.2 
 
 
547 aa  264  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  32.09 
 
 
530 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  33.53 
 
 
546 aa  263  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19540  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.04 
 
 
567 aa  261  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.394832  normal  0.058637 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  33.01 
 
 
547 aa  260  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1949  extracellular solute-binding protein  35.03 
 
 
542 aa  259  6e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0969647  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 
538 aa  259  8e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  32.65 
 
 
556 aa  258  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  32.11 
 
 
531 aa  258  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  32.56 
 
 
543 aa  256  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0206  extracellular solute-binding protein family 5  33.98 
 
 
561 aa  256  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646254  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 
532 aa  256  9e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  31.78 
 
 
532 aa  256  9e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  30.89 
 
 
531 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  30.3 
 
 
531 aa  254  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 
542 aa  253  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  32.77 
 
 
589 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3638  extracellular solute-binding protein family 5  31.77 
 
 
555 aa  253  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339986  normal  0.415005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.34 
 
 
530 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0220  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  33.58 
 
 
542 aa  251  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63568  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 
532 aa  249  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  31.98 
 
 
537 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  32.39 
 
 
610 aa  247  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0256  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  33.52 
 
 
542 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0437  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  33.52 
 
 
574 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0243  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  33.52 
 
 
542 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.38 
 
 
560 aa  246  4.9999999999999997e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  32.33 
 
 
541 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3301  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  33.33 
 
 
542 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3378  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  33.33 
 
 
542 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2969  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  33.33 
 
 
542 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.14 
 
 
541 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2121  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  33.33 
 
 
536 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443402  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2065  extracellular solute-binding protein family 5  30.53 
 
 
543 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  32.23 
 
 
542 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  31.4 
 
 
537 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 
541 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  32.23 
 
 
542 aa  243  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4558  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  30.73 
 
 
540 aa  243  9e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.44901  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  31.84 
 
 
541 aa  243  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  31.84 
 
 
531 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 
542 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3040  extracellular solute-binding protein  32.9 
 
 
542 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.607327 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3090  extracellular solute-binding protein  32.96 
 
 
542 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2956  extracellular solute-binding protein  32.96 
 
 
542 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 
531 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2431  extracellular solute-binding protein  32.58 
 
 
542 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3064  extracellular solute-binding protein  32.58 
 
 
542 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.150422 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3045  extracellular solute-binding protein  32.58 
 
 
542 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 
532 aa  238  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3508  extracellular solute-binding protein  31.26 
 
 
553 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 
532 aa  236  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  31.99 
 
 
531 aa  236  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>