More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19540 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_19540  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 		 567 aa  1166    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.394832  normal  0.058637 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  58.26 
 
 		 566 aa  681    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0658  extracellular solute-binding protein family 5  55.54 
 
 		 577 aa  632  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0206  extracellular solute-binding protein family 5  52.14 
 
 		 561 aa  599  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646254  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0480  extracellular solute-binding protein family 5  51.62 
 
 		 569 aa  551  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105843  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0216  extracellular solute-binding protein  47.62 
 
 		 553 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.923383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0255  extracellular solute-binding protein  47.61 
 
 		 554 aa  484  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192685  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  44.08 
 
 		 556 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  45.23 
 
 		 556 aa  466  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  41.54 
 
 		 610 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  44.18 
 
 		 560 aa  432  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3638  extracellular solute-binding protein family 5  41.64 
 
 		 555 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339986  normal  0.415005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6149  extracellular solute-binding protein family 5  39.43 
 
 		 566 aa  372  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.784749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2548  extracellular solute-binding protein  35.92 
 
 		 584 aa  332  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0070372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2285  extracellular solute-binding protein family 5  34.17 
 
 		 535 aa  298  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000852999 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  34.53 
 
 		 534 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  36.43 
 
 		 595 aa  283  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  34.83 
 
 		 565 aa  281  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 		 525 aa  279  1e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  34.23 
 
 		 535 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  34.87 
 
 		 524 aa  276  5e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  33.9 
 
 		 528 aa  261  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  34.49 
 
 		 529 aa  261  3e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  34.77 
 
 		 532 aa  259  8e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  34.77 
 
 		 532 aa  259  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  34.02 
 
 		 542 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  32.71 
 
 		 538 aa  244  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  31.27 
 
 		 535 aa  237  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 535 aa  237  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  31.14 
 
 		 541 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.58 
 
 		 535 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  32.47 
 
 		 547 aa  234  5e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.39 
 
 		 535 aa  233  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  32.39 
 
 		 535 aa  233  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  32.39 
 
 		 535 aa  233  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.39 
 
 		 535 aa  233  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.39 
 
 		 535 aa  233  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  32.39 
 
 		 535 aa  233  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  32.39 
 
 		 535 aa  233  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  30.51 
 
 		 535 aa  230  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 		 532 aa  227  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  30.71 
 
 		 535 aa  227  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  32.6 
 
 		 528 aa  226  7e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  31.06 
 
 		 526 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  31.06 
 
 		 526 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  30.34 
 
 		 535 aa  225  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  31.06 
 
 		 526 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.06 
 
 		 526 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 		 531 aa  224  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  31.56 
 
 		 535 aa  224  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.56 
 
 		 535 aa  224  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  31.56 
 
 		 535 aa  224  4.9999999999999996e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  31.25 
 
 		 526 aa  224  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 532 aa  220  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  32.7 
 
 		 531 aa  220  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 535 aa  219  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 		 531 aa  219  7.999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  31.81 
 
 		 530 aa  219  8.999999999999998e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  31.46 
 
 		 546 aa  216  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0390  extracellular solute-binding protein family 5  32.64 
 
 		 531 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18086  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31 
 
 		 541 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  31.05 
 
 		 541 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  31 
 
 		 541 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4294  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 530 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.502669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 531 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  31.53 
 
 		 532 aa  212  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3283  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 545 aa  211  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  30.54 
 
 		 531 aa  211  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0422  extracellular solute-binding protein family 5  32.26 
 
 		 531 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00166095  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  30.97 
 
 		 532 aa  209  9e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 		 544 aa  208  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 		 541 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  30.54 
 
 		 531 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  29.21 
 
 		 589 aa  207  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  30.73 
 
 		 545 aa  206  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 532 aa  205  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  31.35 
 
 		 542 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 		 506 aa  205  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4558  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  30.98 
 
 		 540 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.44901  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 		 530 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  30.9 
 
 		 537 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  30.09 
 
 		 529 aa  204  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  30.83 
 
 		 537 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0217  extracellular solute-binding protein family 5  29 
 
 		 588 aa  202  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.745298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  30.58 
 
 		 533 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  29.27 
 
 		 531 aa  201  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  28.95 
 
 		 533 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  30.92 
 
 		 531 aa  200  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  30.55 
 
 		 543 aa  200  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 		 528 aa  199  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 531 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3963  hypothetical protein  34.1 
 
 		 508 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.81037  normal  0.136891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  29.49 
 
 		 542 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0927  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 530 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  28.76 
 
 		 533 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0923  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 530 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.49 
 
 		 542 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 531 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 547 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0884  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.87 
 
 		 530 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0511525  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>