More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2285 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2285  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
535 aa  1097    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000852999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2548  extracellular solute-binding protein  81.85 
 
 
584 aa  880    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0070372  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  42.16 
 
 
560 aa  438  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  42.61 
 
 
556 aa  414  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  43.1 
 
 
556 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  40.19 
 
 
610 aa  385  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0480  extracellular solute-binding protein family 5  39.12 
 
 
569 aa  365  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105843  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0216  extracellular solute-binding protein  37.12 
 
 
553 aa  343  5.999999999999999e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.923383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0255  extracellular solute-binding protein  36.75 
 
 
554 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192685  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.62 
 
 
566 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19540  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.3 
 
 
567 aa  311  2.9999999999999997e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.394832  normal  0.058637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0206  extracellular solute-binding protein family 5  35.97 
 
 
561 aa  309  6.999999999999999e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646254  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08450  Predicted extracellular solute-binding protein, family 5  36.18 
 
 
554 aa  292  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.891256  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0658  extracellular solute-binding protein family 5  35.06 
 
 
577 aa  290  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6149  extracellular solute-binding protein family 5  32.77 
 
 
566 aa  287  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.784749  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3638  extracellular solute-binding protein family 5  33.83 
 
 
555 aa  287  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339986  normal  0.415005 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  31.98 
 
 
535 aa  240  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  31.83 
 
 
534 aa  237  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  31.74 
 
 
525 aa  236  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  31.45 
 
 
565 aa  233  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  30.78 
 
 
524 aa  221  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 
595 aa  211  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  29.28 
 
 
528 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  29.87 
 
 
544 aa  197  5.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  28.7 
 
 
541 aa  196  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  32.71 
 
 
529 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  29.94 
 
 
526 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 
528 aa  176  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  28.43 
 
 
523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 
523 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4294  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 
530 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.502669  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  28.52 
 
 
532 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3283  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 
545 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5632  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  27.91 
 
 
531 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0884  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.89 
 
 
530 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0511525  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0927  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 
530 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0923  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 
530 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 
531 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 
532 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.19 
 
 
532 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 
532 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  28.91 
 
 
495 aa  159  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 
531 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0973  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
532 aa  158  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  29.75 
 
 
518 aa  157  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 
531 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.19 
 
 
531 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3508  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 
553 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360798 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 
534 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 
534 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 
531 aa  157  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 
538 aa  157  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3570  extracellular solute-binding protein family 5  29.22 
 
 
506 aa  157  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.05 
 
 
535 aa  156  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  27.05 
 
 
535 aa  156  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  27.05 
 
 
535 aa  156  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  31.31 
 
 
513 aa  156  7e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.82 
 
 
531 aa  156  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
532 aa  156  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.61 
 
 
541 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
541 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 
531 aa  156  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 
531 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 
532 aa  155  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2065  extracellular solute-binding protein family 5  27.32 
 
 
543 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  24.39 
 
 
532 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  26.68 
 
 
535 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  28.74 
 
 
531 aa  154  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 
512 aa  154  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4568  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 
553 aa  154  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  26.31 
 
 
535 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  26.31 
 
 
535 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  26.31 
 
 
535 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.31 
 
 
535 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.31 
 
 
535 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.36 
 
 
526 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.31 
 
 
535 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  26.31 
 
 
535 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 
547 aa  153  7e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 
541 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0187  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 
529 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000120375 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  29.41 
 
 
520 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  26 
 
 
537 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  27.27 
 
 
533 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 
520 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.17 
 
 
526 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.12 
 
 
535 aa  152  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 
532 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  27.83 
 
 
531 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 
541 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 
529 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  26.95 
 
 
535 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.17 
 
 
526 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3416  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 
528 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.680015 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.17 
 
 
526 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  27.9 
 
 
531 aa  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.97 
 
 
521 aa  151  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 
532 aa  151  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  28.51 
 
 
513 aa  150  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.17 
 
 
526 aa  151  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>