More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1224 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
544 aa  1127    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  49.59 
 
 
526 aa  483  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  41.54 
 
 
528 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  33.66 
 
 
565 aa  301  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  34.22 
 
 
534 aa  292  8e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 
523 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  34.4 
 
 
535 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  33.03 
 
 
541 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3570  extracellular solute-binding protein family 5  33.13 
 
 
506 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  34.26 
 
 
524 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  32.64 
 
 
532 aa  256  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  31.83 
 
 
532 aa  250  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  31.52 
 
 
546 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2065  extracellular solute-binding protein family 5  30.78 
 
 
543 aa  247  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 
542 aa  247  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  31.91 
 
 
531 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  31.44 
 
 
530 aa  246  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  30.04 
 
 
589 aa  243  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 
538 aa  243  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 
529 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 
531 aa  242  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 
532 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  32.88 
 
 
532 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  32.12 
 
 
523 aa  238  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 
508 aa  237  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.16 
 
 
535 aa  236  6e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  30.23 
 
 
535 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  29.96 
 
 
535 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  29.96 
 
 
535 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.96 
 
 
535 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  29.96 
 
 
535 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  29.96 
 
 
535 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.96 
 
 
535 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.96 
 
 
535 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 
535 aa  233  8.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.57 
 
 
526 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  30.23 
 
 
535 aa  232  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.57 
 
 
526 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.57 
 
 
526 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 
544 aa  231  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.57 
 
 
526 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  31.42 
 
 
543 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  31.68 
 
 
532 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  31.35 
 
 
547 aa  230  4e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.38 
 
 
526 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 
530 aa  230  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  30.72 
 
 
545 aa  230  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1949  extracellular solute-binding protein  32.61 
 
 
542 aa  229  7e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0969647  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  29.9 
 
 
535 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  29.88 
 
 
535 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  29.88 
 
 
535 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.88 
 
 
535 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  29.07 
 
 
535 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.38 
 
 
530 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  31.29 
 
 
509 aa  226  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  32.34 
 
 
556 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  30.31 
 
 
533 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 
532 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0927  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 
530 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0437  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  31.49 
 
 
574 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0243  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  31.49 
 
 
542 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0256  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  31.49 
 
 
542 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0220  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  31.68 
 
 
542 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 
531 aa  223  9e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0217  extracellular solute-binding protein family 5  28.92 
 
 
588 aa  222  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.745298  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0923  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 
530 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31.61 
 
 
528 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3301  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  31.09 
 
 
542 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2969  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  31.09 
 
 
542 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3378  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  31.09 
 
 
542 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3090  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 
542 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2121  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  31.09 
 
 
536 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443402  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  32.56 
 
 
531 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2956  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 
542 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0884  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30 
 
 
530 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0511525  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.36 
 
 
542 aa  220  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3064  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 
542 aa  220  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.150422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2431  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 
542 aa  220  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3045  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 
542 aa  220  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0390  extracellular solute-binding protein family 5  32.35 
 
 
531 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18086  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  29.57 
 
 
531 aa  219  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0422  extracellular solute-binding protein family 5  32.75 
 
 
531 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00166095  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 
542 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4294  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 
530 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.502669  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.46 
 
 
520 aa  219  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  31.36 
 
 
542 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 
532 aa  218  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  29.73 
 
 
533 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 
541 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 
535 aa  218  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  30.29 
 
 
537 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3040  extracellular solute-binding protein  31.42 
 
 
542 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.607327 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  29.53 
 
 
531 aa  217  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  30.02 
 
 
532 aa  217  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3283  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 
545 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5632  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0973  extracellular solute-binding protein  29.88 
 
 
532 aa  216  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4558  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  28.79 
 
 
540 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.44901  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 
531 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  29.96 
 
 
537 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1235  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.9 
 
 
542 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650831  normal  0.763441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>