More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0453 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  100 
 
 		 526 aa  1080    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  47.33 
 
 		 544 aa  494  9.999999999999999e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  46.21 
 
 		 528 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  37.66 
 
 		 534 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  37.66 
 
 		 535 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  39.8 
 
 		 524 aa  333  5e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  35.02 
 
 		 541 aa  310  4e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  35.37 
 
 		 523 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3570  extracellular solute-binding protein family 5  35.05 
 
 		 506 aa  300  5e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  34.44 
 
 		 565 aa  299  9e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  34.98 
 
 		 531 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  33.27 
 
 		 538 aa  282  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  32.04 
 
 		 542 aa  279  8e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  34.97 
 
 		 508 aa  279  9e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  33.46 
 
 		 532 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 		 529 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  34.18 
 
 		 545 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  33 
 
 		 532 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  32.83 
 
 		 544 aa  274  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  32.28 
 
 		 546 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  32.49 
 
 		 530 aa  271  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1949  extracellular solute-binding protein  34.58 
 
 		 542 aa  270  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0969647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  31.42 
 
 		 535 aa  269  8e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  31.75 
 
 		 531 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  31.37 
 
 		 509 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  33.92 
 
 		 543 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  31.42 
 
 		 535 aa  266  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4557  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.69 
 
 		 535 aa  264  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  32.03 
 
 		 523 aa  263  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  31.63 
 
 		 532 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  31.63 
 
 		 532 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  34.35 
 
 		 531 aa  260  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0220  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  32.28 
 
 		 542 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63568  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  33.27 
 
 		 531 aa  259  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  31.42 
 
 		 535 aa  258  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  31.42 
 
 		 535 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  31.17 
 
 		 520 aa  257  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4234  extracellular solute-binding protein  32.56 
 
 		 535 aa  257  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 535 aa  256  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0437  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  32.81 
 
 		 574 aa  256  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217985  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 		 547 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  31.3 
 
 		 532 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0243  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  32.81 
 
 		 542 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0256  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  32.81 
 
 		 542 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 		 533 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 530 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3301  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  32.41 
 
 		 542 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2969  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  32.41 
 
 		 542 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2121  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  32.41 
 
 		 536 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443402  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3378  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  32.41 
 
 		 542 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  32.21 
 
 		 532 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2956  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 542 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  32.49 
 
 		 532 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 		 528 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3090  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 542 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  31.5 
 
 		 526 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  31.5 
 
 		 526 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  31.15 
 
 		 537 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.5 
 
 		 526 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  31.5 
 
 		 526 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3040  extracellular solute-binding protein  32.03 
 
 		 542 aa  250  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.607327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  30.43 
 
 		 533 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  30.23 
 
 		 533 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3064  extracellular solute-binding protein  31.34 
 
 		 542 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2431  extracellular solute-binding protein  31.34 
 
 		 542 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3045  extracellular solute-binding protein  31.34 
 
 		 542 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  30.4 
 
 		 531 aa  249  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  30.83 
 
 		 535 aa  249  7e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.83 
 
 		 535 aa  249  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  30.83 
 
 		 535 aa  249  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 532 aa  249  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  32.42 
 
 		 547 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  31.3 
 
 		 526 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.63 
 
 		 535 aa  248  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  30.63 
 
 		 535 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  30.63 
 
 		 535 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.63 
 
 		 535 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.63 
 
 		 535 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  30.08 
 
 		 521 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  30.63 
 
 		 535 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.63 
 
 		 535 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  30.63 
 
 		 535 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.51 
 
 		 530 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 521 aa  247  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  30.08 
 
 		 521 aa  247  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.08 
 
 		 521 aa  247  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  30.08 
 
 		 521 aa  247  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  31.09 
 
 		 537 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  33.2 
 
 		 542 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 		 551 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  32.08 
 
 		 547 aa  246  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4558  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  31.98 
 
 		 540 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.44901  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6392  ABC oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.84 
 
 		 542 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0973  extracellular solute-binding protein  31.66 
 
 		 532 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  30.31 
 
 		 535 aa  244  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 542 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  30.17 
 
 		 532 aa  242  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  31.68 
 
 		 547 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  32.21 
 
 		 542 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0390  extracellular solute-binding protein family 5  32.74 
 
 		 531 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18086  normal  0.296586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>