More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2431 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0243  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  91.51 
 
 
542 aa  1016    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  71.07 
 
 
547 aa  804    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0884  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  58.19 
 
 
530 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0511525  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  65.59 
 
 
541 aa  740    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  66.15 
 
 
541 aa  733    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  65.02 
 
 
541 aa  729    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4557  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  61.39 
 
 
535 aa  672    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4558  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  62.48 
 
 
540 aa  712    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.44901  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  57.6 
 
 
530 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  69.29 
 
 
547 aa  813    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  62.29 
 
 
532 aa  709    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3301  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  90.96 
 
 
542 aa  1011    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4234  extracellular solute-binding protein  61.78 
 
 
535 aa  679    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  61.85 
 
 
542 aa  705    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  58.16 
 
 
530 aa  657    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0437  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  91.51 
 
 
574 aa  1017    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217985  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  63.51 
 
 
532 aa  690    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  60.07 
 
 
533 aa  684    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3923  extracellular solute-binding protein  60.5 
 
 
528 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333304  normal  0.449349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  65.78 
 
 
541 aa  741    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  57.61 
 
 
544 aa  650    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6392  ABC oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  97.05 
 
 
542 aa  1080    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2067  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  60.2 
 
 
553 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110283  normal  0.976863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0923  extracellular solute-binding protein  60 
 
 
530 aa  659    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3378  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  90.96 
 
 
542 aa  1011    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0220  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  91.51 
 
 
542 aa  1030    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63568  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3508  extracellular solute-binding protein  60.59 
 
 
553 aa  665    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  64.15 
 
 
533 aa  716    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  69.29 
 
 
547 aa  810    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  85.06 
 
 
542 aa  966    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3064  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
542 aa  1129    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.150422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2431  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
542 aa  1129    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4350  extracellular solute-binding protein  60.59 
 
 
553 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.801154  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2956  extracellular solute-binding protein  98.15 
 
 
542 aa  1111    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0256  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  91.51 
 
 
542 aa  1016    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2121  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  90.86 
 
 
536 aa  998    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443402  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  85.42 
 
 
542 aa  969    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4568  extracellular solute-binding protein  61.51 
 
 
553 aa  649    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0927  extracellular solute-binding protein  58.58 
 
 
530 aa  660    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3090  extracellular solute-binding protein  97.97 
 
 
542 aa  1089    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3416  extracellular solute-binding protein  60.31 
 
 
528 aa  647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.680015 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4294  extracellular solute-binding protein  58.23 
 
 
530 aa  650    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.502669  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  66.17 
 
 
537 aa  750    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  63.06 
 
 
533 aa  720    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  85.82 
 
 
543 aa  967    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3045  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
542 aa  1129    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4016  extracellular solute-binding protein  60.59 
 
 
553 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  62.52 
 
 
531 aa  714    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3040  extracellular solute-binding protein  96.86 
 
 
542 aa  1081    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.607327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  65.8 
 
 
537 aa  749    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2969  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  90.96 
 
 
542 aa  1011    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  58.38 
 
 
547 aa  634  1e-180  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  57.44 
 
 
535 aa  628  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  56.84 
 
 
535 aa  625  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  56.35 
 
 
535 aa  622  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  56.87 
 
 
535 aa  622  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  54.92 
 
 
535 aa  614  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  54.66 
 
 
535 aa  614  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  55.62 
 
 
529 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  54.66 
 
 
535 aa  614  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  54.66 
 
 
535 aa  614  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  55.88 
 
 
526 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  55.88 
 
 
526 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  55.88 
 
 
526 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  55.68 
 
 
526 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  55.88 
 
 
526 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  54.65 
 
 
535 aa  602  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  54.72 
 
 
535 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  54.72 
 
 
535 aa  599  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  54.72 
 
 
535 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  54.72 
 
 
535 aa  599  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  54.91 
 
 
535 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  54.72 
 
 
535 aa  598  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  54.72 
 
 
535 aa  599  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  54.72 
 
 
535 aa  599  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  54.37 
 
 
530 aa  580  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  54.31 
 
 
532 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  53.73 
 
 
531 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  53.54 
 
 
531 aa  560  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  52.08 
 
 
506 aa  555  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  52.84 
 
 
546 aa  553  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  52.64 
 
 
532 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  52.05 
 
 
545 aa  551  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  52.64 
 
 
532 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  52.35 
 
 
532 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  49.81 
 
 
531 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  51.37 
 
 
538 aa  548  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  49.81 
 
 
532 aa  543  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  50 
 
 
531 aa  543  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  50.19 
 
 
531 aa  543  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
531 aa  539  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  51.38 
 
 
531 aa  541  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1949  extracellular solute-binding protein  52.26 
 
 
542 aa  537  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0969647  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0422  extracellular solute-binding protein family 5  52.46 
 
 
531 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00166095  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0390  extracellular solute-binding protein family 5  51.22 
 
 
531 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18086  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  49.81 
 
 
531 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  47.99 
 
 
542 aa  525  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  48.69 
 
 
532 aa  512  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.55 
 
 
528 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  48.13 
 
 
532 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>