More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2405 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
532 aa  1071    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  36.83 
 
 
521 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  36.83 
 
 
521 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  36.83 
 
 
521 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  36.83 
 
 
521 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  36.83 
 
 
521 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  35.82 
 
 
534 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  34.57 
 
 
535 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  38 
 
 
524 aa  330  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  34.18 
 
 
565 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  34.27 
 
 
532 aa  280  3e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  34.19 
 
 
544 aa  280  6e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  32.6 
 
 
544 aa  278  2e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  32.91 
 
 
541 aa  278  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  34.42 
 
 
509 aa  276  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  33.54 
 
 
520 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  33.77 
 
 
528 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  35.44 
 
 
528 aa  270  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  33.77 
 
 
510 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  34.21 
 
 
575 aa  263  4.999999999999999e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  30.36 
 
 
520 aa  259  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.95 
 
 
538 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  35.78 
 
 
505 aa  258  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  33.88 
 
 
502 aa  257  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  31.29 
 
 
512 aa  257  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  32.51 
 
 
530 aa  256  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  31.07 
 
 
512 aa  256  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  30.85 
 
 
512 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  32.64 
 
 
532 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  30.85 
 
 
512 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  30.85 
 
 
512 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  30.75 
 
 
535 aa  254  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  31.21 
 
 
512 aa  254  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  31.21 
 
 
512 aa  254  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  31.33 
 
 
535 aa  254  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  31.53 
 
 
535 aa  253  7e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30.99 
 
 
512 aa  253  9.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  31.02 
 
 
535 aa  252  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30.99 
 
 
512 aa  252  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  30.99 
 
 
512 aa  252  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  30.99 
 
 
493 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  30.99 
 
 
512 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  31.87 
 
 
519 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 
512 aa  251  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  30.99 
 
 
512 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  33.14 
 
 
527 aa  251  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  33.11 
 
 
505 aa  249  7e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  33.26 
 
 
518 aa  249  8e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  31.46 
 
 
545 aa  249  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  31.91 
 
 
495 aa  248  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  29.94 
 
 
524 aa  248  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  29.81 
 
 
545 aa  247  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  33.71 
 
 
520 aa  248  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  36.02 
 
 
510 aa  247  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 
538 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  28.75 
 
 
514 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  29.18 
 
 
514 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  31.07 
 
 
509 aa  244  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  31.77 
 
 
540 aa  243  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 
532 aa  243  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 
539 aa  243  6e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 
535 aa  243  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  31.3 
 
 
516 aa  243  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  31.87 
 
 
531 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.36 
 
 
505 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  32.11 
 
 
531 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  30.26 
 
 
546 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 
512 aa  240  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.4 
 
 
535 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  32.33 
 
 
513 aa  239  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  30.4 
 
 
535 aa  239  8e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  30.4 
 
 
535 aa  239  8e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 
512 aa  239  8e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.4 
 
 
535 aa  239  8e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  30.4 
 
 
535 aa  239  8e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.4 
 
 
535 aa  239  8e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  30.4 
 
 
535 aa  239  8e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  30.27 
 
 
526 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.27 
 
 
526 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  30.27 
 
 
526 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  30.27 
 
 
526 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 
517 aa  239  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.19 
 
 
535 aa  239  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  30.06 
 
 
526 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.27 
 
 
535 aa  237  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  31.91 
 
 
513 aa  237  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  30.27 
 
 
535 aa  237  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  30.27 
 
 
535 aa  237  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 
535 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.22 
 
 
520 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  31.19 
 
 
540 aa  236  8e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 
520 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  29.42 
 
 
520 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  30.26 
 
 
517 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  30.24 
 
 
517 aa  234  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  30.9 
 
 
513 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  30.61 
 
 
551 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 
520 aa  233  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  30.04 
 
 
521 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  29.7 
 
 
526 aa  232  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>