More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3852 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 521 aa  1071    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  36.45 
 
 		 517 aa  303  6.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1189  4-phytase  34.05 
 
 		 523 aa  301  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  35.08 
 
 		 495 aa  291  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  33.68 
 
 		 500 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  31.25 
 
 		 517 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  33.6 
 
 		 502 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  33.33 
 
 		 502 aa  254  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0112  extracellular solute-binding protein  33.74 
 
 		 506 aa  252  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  33.95 
 
 		 498 aa  250  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  33.78 
 
 		 509 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  33.08 
 
 		 520 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  32.72 
 
 		 501 aa  243  7.999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  31.63 
 
 		 524 aa  239  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  33.93 
 
 		 513 aa  237  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  32.38 
 
 		 490 aa  233  9e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  32.79 
 
 		 490 aa  230  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  29.8 
 
 		 534 aa  230  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  31.09 
 
 		 552 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  33.06 
 
 		 528 aa  228  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  32.37 
 
 		 503 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.64 
 
 		 535 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  31.08 
 
 		 534 aa  223  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  30.25 
 
 		 502 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  32.55 
 
 		 528 aa  220  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  30.8 
 
 		 546 aa  219  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.78 
 
 		 538 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  32.94 
 
 		 495 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5083  4-phytase  32.11 
 
 		 495 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.116329 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 		 538 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  30.29 
 
 		 533 aa  217  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  30.4 
 
 		 565 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 		 512 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 		 512 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 		 512 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  29.87 
 
 		 509 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  31.49 
 
 		 519 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  31.68 
 
 		 530 aa  209  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.41 
 
 		 534 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  30.81 
 
 		 524 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  29.37 
 
 		 541 aa  208  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 		 536 aa  208  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  30.37 
 
 		 513 aa  206  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  31.13 
 
 		 505 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  31.49 
 
 		 513 aa  205  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  30.67 
 
 		 518 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 		 510 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  29.18 
 
 		 508 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  29.27 
 
 		 515 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  30.18 
 
 		 513 aa  201  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 539 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 528 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.99 
 
 		 508 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  32.22 
 
 		 524 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.36 
 
 		 534 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  30.47 
 
 		 520 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  30.64 
 
 		 515 aa  192  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 516 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  30.67 
 
 		 517 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  30.75 
 
 		 540 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.8 
 
 		 510 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 520 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  31.05 
 
 		 534 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  30.68 
 
 		 532 aa  190  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.63 
 
 		 521 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0461  extracellular solute-binding protein  29.98 
 
 		 520 aa  191  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.63 
 
 		 521 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.63 
 
 		 521 aa  190  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 521 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.2 
 
 		 540 aa  190  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.63 
 
 		 521 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 520 aa  189  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  29.9 
 
 		 522 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.12 
 
 		 540 aa  189  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  28.86 
 
 		 527 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.81 
 
 		 503 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.32 
 
 		 539 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 540 aa  189  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  28.33 
 
 		 544 aa  188  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 544 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  30.36 
 
 		 540 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 503 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  30.78 
 
 		 531 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 544 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  30.57 
 
 		 528 aa  187  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  29.59 
 
 		 544 aa  187  6e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  29.77 
 
 		 516 aa  186  7e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 528 aa  186  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 		 544 aa  186  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 		 527 aa  186  9e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0232  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 517 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  29.18 
 
 		 520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 510 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 494 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.99 
 
 		 520 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  32.19 
 
 		 495 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 529 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  31.45 
 
 		 493 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6358  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 		 519 aa  183  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>