More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1961 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 513 aa  1045    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  33.86 
 
 		 521 aa  247  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  32.15 
 
 		 527 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  33.4 
 
 		 505 aa  239  5.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  32.76 
 
 		 519 aa  236  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  32.2 
 
 		 495 aa  233  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  33.06 
 
 		 520 aa  229  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  30.63 
 
 		 502 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  29.48 
 
 		 517 aa  227  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 		 500 aa  226  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.29 
 
 		 534 aa  223  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  30.9 
 
 		 502 aa  223  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  31.61 
 
 		 521 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  31.22 
 
 		 524 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  32.66 
 
 		 544 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  31.4 
 
 		 521 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  31.4 
 
 		 521 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  31.4 
 
 		 521 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 521 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 501 aa  217  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.95 
 
 		 535 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  31.79 
 
 		 517 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  31.54 
 
 		 510 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 		 498 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5083  4-phytase  29.9 
 
 		 495 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.116329 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  31.1 
 
 		 552 aa  212  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  31.59 
 
 		 509 aa  211  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  30.62 
 
 		 544 aa  210  6e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 		 510 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  31.95 
 
 		 528 aa  207  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  30.72 
 
 		 531 aa  206  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  31.78 
 
 		 540 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 540 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31.69 
 
 		 528 aa  203  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 		 538 aa  202  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  28.87 
 
 		 495 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 		 511 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  29.65 
 
 		 516 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  32.5 
 
 		 521 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  31.89 
 
 		 520 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.98 
 
 		 512 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  27.95 
 
 		 503 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.95 
 
 		 502 aa  200  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.61 
 
 		 505 aa  200  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 		 512 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 		 512 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 		 512 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0232  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 		 517 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.79 
 
 		 512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.79 
 
 		 512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.79 
 
 		 512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 490 aa  198  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  32.19 
 
 		 517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.79 
 
 		 512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.25 
 
 		 510 aa  197  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  29.85 
 
 		 512 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  29.41 
 
 		 490 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 		 520 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  29.59 
 
 		 512 aa  196  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  31.2 
 
 		 540 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  29.59 
 
 		 512 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3427  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 		 526 aa  196  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  29.69 
 
 		 493 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 		 512 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  29.65 
 
 		 512 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  29.44 
 
 		 512 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  29.44 
 
 		 512 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4041  extracellular solute-binding protein family 5  28.97 
 
 		 543 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457031  normal  0.172562 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  29.44 
 
 		 512 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  30.65 
 
 		 520 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  30.43 
 
 		 520 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.65 
 
 		 520 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 		 520 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 515 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  30.75 
 
 		 509 aa  192  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.4 
 
 		 541 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  30.15 
 
 		 514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  29.43 
 
 		 524 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 520 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 520 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  29.56 
 
 		 514 aa  190  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  30.23 
 
 		 523 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 520 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  29.58 
 
 		 565 aa  189  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 519 aa  189  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 		 520 aa  189  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 520 aa  188  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  30.54 
 
 		 532 aa  187  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  31.12 
 
 		 522 aa  186  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 		 512 aa  186  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  30.29 
 
 		 517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 510 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0112  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 506 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  30.79 
 
 		 521 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 		 538 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  26.9 
 
 		 520 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  29.44 
 
 		 520 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 544 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  27.99 
 
 		 556 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>