More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0409 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 520 aa  1071    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  62.86 
 
 		 525 aa  685    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  47.76 
 
 		 519 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  46.21 
 
 		 522 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  44.83 
 
 		 529 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  44.36 
 
 		 529 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  43.48 
 
 		 529 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  44.12 
 
 		 529 aa  438  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  43.36 
 
 		 526 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  43.62 
 
 		 513 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  45.42 
 
 		 527 aa  415  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  42.11 
 
 		 518 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  43.03 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  41.91 
 
 		 545 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  41.49 
 
 		 545 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  39.35 
 
 		 540 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6274  extracellular solute-binding protein family 5  39.59 
 
 		 511 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0245039 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  43.41 
 
 		 496 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6090  extracellular solute-binding protein family 5  38.71 
 
 		 538 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  37.19 
 
 		 536 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  37.92 
 
 		 538 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  39.58 
 
 		 535 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  39.39 
 
 		 535 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  39.58 
 
 		 535 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  39.3 
 
 		 527 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  39.07 
 
 		 537 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  38.57 
 
 		 539 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6444  twin-arginine translocation pathway signal  38.38 
 
 		 527 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6277  extracellular solute-binding protein  38.38 
 
 		 527 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0281814  normal  0.114415 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6679  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component  38.38 
 
 		 527 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6354  extracellular solute-binding protein  38.07 
 
 		 527 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6057  extracellular solute-binding protein  38.07 
 
 		 527 aa  353  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  38.65 
 
 		 519 aa  352  7e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  38.6 
 
 		 534 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  37.14 
 
 		 535 aa  347  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  38.46 
 
 		 536 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.66 
 
 		 526 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3524  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  38.6 
 
 		 534 aa  342  7e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.413747  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 		 535 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  37.69 
 
 		 536 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  37.96 
 
 		 537 aa  339  9e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  38.21 
 
 		 534 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  36.19 
 
 		 540 aa  338  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  36.99 
 
 		 537 aa  336  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  37.88 
 
 		 513 aa  332  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  36.85 
 
 		 509 aa  331  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  33 
 
 		 513 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  33.33 
 
 		 516 aa  243  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.82 
 
 		 516 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  29.84 
 
 		 532 aa  229  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 		 515 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  32.6 
 
 		 538 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0576  extracellular solute-binding protein family 5  30.06 
 
 		 533 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 517 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  28.37 
 
 		 502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5692  extracellular solute-binding protein family 5  27.37 
 
 		 555 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.31 
 
 		 513 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3559  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 526 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3338  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 524 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  28.66 
 
 		 503 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 550 aa  176  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 		 538 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 517 aa  172  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 517 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2062  twin-arginine translocation pathway signal  27.65 
 
 		 550 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.511061  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 561 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1360  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 543 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0151381 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  27.49 
 
 		 554 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.49 
 
 		 554 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2156  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 543 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.470572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1417  twin-arginine translocation pathway signal  29.25 
 
 		 555 aa  160  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3756  putative peptide ABC transporter, substrate- binding protein  26.19 
 
 		 514 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279615  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  28.81 
 
 		 514 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  25.94 
 
 		 517 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  29.81 
 
 		 508 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0232  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 517 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3973  extracellular solute-binding protein family 5  29.07 
 
 		 505 aa  153  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  27.07 
 
 		 527 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.51 
 
 		 505 aa  151  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6371  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 		 504 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 522 aa  146  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.46 
 
 		 525 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2703  ABC dipeptide transporter, periplasmic binding protein  28.11 
 
 		 501 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22446  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.54 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.7 
 
 		 520 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6191  extracellular solute-binding protein family 5  26.54 
 
 		 504 aa  144  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172417  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 544 aa  144  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  26.44 
 
 		 516 aa  143  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 521 aa  143  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 500 aa  143  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.55 
 
 		 508 aa  143  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  25.99 
 
 		 520 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0112  extracellular solute-binding protein family 5  23.85 
 
 		 524 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214652  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  27.14 
 
 		 497 aa  141  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.62 
 
 		 532 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 534 aa  139  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  26.29 
 
 		 529 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0112  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 506 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  25.11 
 
 		 502 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>