More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4502 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  65.76 
 
 
529 aa  736    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  75.63 
 
 
529 aa  830    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
526 aa  1079    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  66.41 
 
 
529 aa  743    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  66.21 
 
 
529 aa  743    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  52.3 
 
 
527 aa  545  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  43.58 
 
 
525 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  45.82 
 
 
519 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  43.83 
 
 
520 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  40.12 
 
 
522 aa  398  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  40.7 
 
 
513 aa  392  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  40.64 
 
 
518 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  42.2 
 
 
496 aa  365  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  39.96 
 
 
512 aa  362  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6274  extracellular solute-binding protein family 5  39.34 
 
 
511 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0245039 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  40.76 
 
 
535 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  40.2 
 
 
535 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  40 
 
 
535 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  38.2 
 
 
534 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3524  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  39.5 
 
 
534 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.413747  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  39.29 
 
 
534 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  35.65 
 
 
536 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  35.09 
 
 
545 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  36.47 
 
 
538 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6090  extracellular solute-binding protein family 5  35.4 
 
 
538 aa  302  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194048  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  34.31 
 
 
545 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 
540 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  34.67 
 
 
519 aa  294  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  35.89 
 
 
536 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.36 
 
 
526 aa  292  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  34.97 
 
 
539 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  34.49 
 
 
535 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  33.91 
 
 
537 aa  289  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  35.95 
 
 
535 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 
513 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  34.74 
 
 
536 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  34.36 
 
 
537 aa  273  8.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  33.74 
 
 
540 aa  272  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6354  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 
527 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6057  extracellular solute-binding protein  33.88 
 
 
527 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6444  twin-arginine translocation pathway signal  33.47 
 
 
527 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6277  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 
527 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0281814  normal  0.114415 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6679  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component  33.47 
 
 
527 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140574  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 
527 aa  261  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  32.56 
 
 
537 aa  260  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  32.06 
 
 
509 aa  255  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  33.4 
 
 
516 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  31.39 
 
 
515 aa  221  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.7 
 
 
516 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 
513 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  28.85 
 
 
532 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  30.79 
 
 
538 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 
561 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 
517 aa  180  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 
517 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 
554 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
550 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  29.31 
 
 
538 aa  176  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3559  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 
526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43971  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5692  extracellular solute-binding protein family 5  26.17 
 
 
555 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 
517 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.69 
 
 
554 aa  170  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3338  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 
524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165624  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0576  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 
533 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.08 
 
 
502 aa  160  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 
523 aa  160  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3973  extracellular solute-binding protein family 5  29.25 
 
 
505 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  29.05 
 
 
503 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3756  putative peptide ABC transporter, substrate- binding protein  28.07 
 
 
514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279615  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.03 
 
 
520 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.19 
 
 
525 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
510 aa  144  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.71 
 
 
512 aa  143  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6191  extracellular solute-binding protein family 5  28.48 
 
 
504 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172417  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 
522 aa  141  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 
522 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.43 
 
 
510 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.15 
 
 
521 aa  136  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6371  extracellular solute-binding protein family 5  27.64 
 
 
504 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.96 
 
 
521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.96 
 
 
521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 
521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.96 
 
 
521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  25.96 
 
 
565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1360  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
543 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0151381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 
516 aa  133  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  29.12 
 
 
508 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  26.47 
 
 
517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  27.73 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.24 
 
 
503 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  27.23 
 
 
523 aa  131  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
521 aa  130  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 
503 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  25.92 
 
 
527 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2156  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
543 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.470572  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  27.64 
 
 
516 aa  128  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3049  twin-arginine translocation pathway signal  26.33 
 
 
554 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0232  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 
517 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>