More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6105 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 518 aa  1069    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  58.81 
 
 		 496 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  53.1 
 
 		 512 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6274  extracellular solute-binding protein family 5  51.55 
 
 		 511 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0245039 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  47.21 
 
 		 522 aa  468  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  47.05 
 
 		 519 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  42.19 
 
 		 520 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  42.63 
 
 		 529 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  41.14 
 
 		 525 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  42.22 
 
 		 529 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  41.09 
 
 		 529 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  40.64 
 
 		 526 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  40.96 
 
 		 535 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  38.42 
 
 		 513 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  40.96 
 
 		 535 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  40.38 
 
 		 535 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  41.17 
 
 		 534 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  38.77 
 
 		 529 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  40.74 
 
 		 534 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3524  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  40.74 
 
 		 534 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.413747  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  39.46 
 
 		 527 aa  346  6e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  35.56 
 
 		 540 aa  316  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6090  extracellular solute-binding protein family 5  34.55 
 
 		 538 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  35.5 
 
 		 539 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  33.97 
 
 		 538 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.53 
 
 		 526 aa  302  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  35.5 
 
 		 535 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  35.1 
 
 		 513 aa  293  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  34.35 
 
 		 537 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  35.09 
 
 		 545 aa  291  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  34.96 
 
 		 545 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  35.82 
 
 		 519 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  32.92 
 
 		 535 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  33.06 
 
 		 536 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6354  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 		 527 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6057  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 		 527 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  33.61 
 
 		 509 aa  282  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 		 536 aa  282  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6444  twin-arginine translocation pathway signal  35.25 
 
 		 527 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6679  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component  35.25 
 
 		 527 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6277  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 		 527 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0281814  normal  0.114415 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  34.37 
 
 		 527 aa  280  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  33.27 
 
 		 537 aa  280  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  34.69 
 
 		 540 aa  280  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  32.65 
 
 		 536 aa  276  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 		 537 aa  271  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  32.1 
 
 		 516 aa  246  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  32.45 
 
 		 532 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.8 
 
 		 516 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 515 aa  222  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  29.87 
 
 		 538 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 		 513 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3559  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 526 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  29.21 
 
 		 538 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  29.8 
 
 		 502 aa  177  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0576  extracellular solute-binding protein family 5  27.49 
 
 		 533 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 517 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  29.32 
 
 		 514 aa  171  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5692  extracellular solute-binding protein family 5  26.97 
 
 		 555 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3338  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 524 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 561 aa  167  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 550 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3756  putative peptide ABC transporter, substrate- binding protein  28.7 
 
 		 514 aa  163  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279615  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.65 
 
 		 554 aa  163  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.62 
 
 		 510 aa  160  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  28.41 
 
 		 554 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 523 aa  157  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  29.68 
 
 		 519 aa  156  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.35 
 
 		 505 aa  154  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  28.66 
 
 		 509 aa  154  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.04 
 
 		 513 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  27.35 
 
 		 522 aa  153  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.11 
 
 		 508 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  27.01 
 
 		 512 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  27.01 
 
 		 514 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  32.94 
 
 		 506 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  27.03 
 
 		 503 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  26.33 
 
 		 499 aa  143  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1360  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 543 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0151381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0112  extracellular solute-binding protein family 5  26.18 
 
 		 524 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214652  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 		 500 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.67 
 
 		 525 aa  141  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.18 
 
 		 540 aa  141  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3973  extracellular solute-binding protein family 5  28.29 
 
 		 505 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617507  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  27.43 
 
 		 516 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 493 aa  140  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 517 aa  140  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  27.84 
 
 		 516 aa  139  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.93 
 
 		 520 aa  139  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 511 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 492 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 522 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 517 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  26.37 
 
 		 509 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2156  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 543 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.470572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  25.57 
 
 		 537 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  27.16 
 
 		 501 aa  136  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  28.04 
 
 		 499 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1417  twin-arginine translocation pathway signal  26.74 
 
 		 555 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  0.153951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>