More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3175 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  84.49 
 
 		 561 aa  966    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 554 aa  1120    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  95.67 
 
 		 554 aa  1078    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  55.33 
 
 		 550 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  38.43 
 
 		 523 aa  327  3e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  32.9 
 
 		 538 aa  224  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5692  extracellular solute-binding protein family 5  27.32 
 
 		 555 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  27.39 
 
 		 527 aa  186  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  32.72 
 
 		 516 aa  180  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  29.98 
 
 		 519 aa  179  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  26.44 
 
 		 529 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 529 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 		 526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  29.08 
 
 		 538 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  26.25 
 
 		 529 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3524  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.89 
 
 		 534 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.413747  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 534 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  28.28 
 
 		 531 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 540 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  30.72 
 
 		 532 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 538 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 534 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 		 517 aa  160  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  28.41 
 
 		 518 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 529 aa  160  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.83 
 
 		 502 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  27.18 
 
 		 522 aa  159  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.68 
 
 		 545 aa  158  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 520 aa  158  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  27.78 
 
 		 545 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 		 519 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.04 
 
 		 505 aa  157  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  27.53 
 
 		 509 aa  156  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.44 
 
 		 516 aa  156  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 525 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  26.73 
 
 		 520 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 521 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.6 
 
 		 521 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 535 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 		 530 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 		 532 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  31 
 
 		 517 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 505 aa  152  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  28.88 
 
 		 528 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  27.76 
 
 		 535 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 535 aa  151  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6090  extracellular solute-binding protein family 5  26.7 
 
 		 538 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194048  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.58 
 
 		 521 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.58 
 
 		 521 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.58 
 
 		 521 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.55 
 
 		 538 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  27.82 
 
 		 565 aa  150  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 521 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 536 aa  150  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  27.43 
 
 		 526 aa  150  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.98 
 
 		 537 aa  150  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  26.01 
 
 		 513 aa  150  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  25.58 
 
 		 540 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.66 
 
 		 508 aa  149  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.62 
 
 		 526 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.38 
 
 		 521 aa  148  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.81 
 
 		 535 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 531 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.38 
 
 		 534 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  24.03 
 
 		 536 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  31.93 
 
 		 515 aa  147  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 		 532 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  27.07 
 
 		 513 aa  146  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1490  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 		 555 aa  146  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.758744 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 		 532 aa  146  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  28.41 
 
 		 517 aa  146  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  27.86 
 
 		 514 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 527 aa  146  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 539 aa  146  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 		 496 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  26.48 
 
 		 522 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  29.22 
 
 		 544 aa  145  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 513 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.24 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  27.2 
 
 		 528 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 537 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.01 
 
 		 516 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  24.17 
 
 		 536 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0576  extracellular solute-binding protein family 5  29.1 
 
 		 533 aa  143  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  27.67 
 
 		 509 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 526 aa  141  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  27.03 
 
 		 495 aa  141  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1417  twin-arginine translocation pathway signal  25.91 
 
 		 555 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  27.38 
 
 		 512 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  28.82 
 
 		 508 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 526 aa  139  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 		 535 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 528 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 527 aa  139  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 525 aa  139  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1189  4-phytase  26.88 
 
 		 523 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2156  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 543 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.470572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 535 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 535 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 		 514 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>