More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3678 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  61.9 
 
 		 522 aa  635    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  62.62 
 
 		 527 aa  681    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  66.6 
 
 		 520 aa  743    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  100 
 
 		 525 aa  1079    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  34.16 
 
 		 519 aa  269  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2595  putative extracellular solute-binding protein  32.29 
 
 		 507 aa  259  9e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  34.01 
 
 		 545 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  33.59 
 
 		 524 aa  252  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  31.69 
 
 		 521 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  32.62 
 
 		 512 aa  238  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 		 521 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  31.5 
 
 		 521 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  31.5 
 
 		 521 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  31.5 
 
 		 521 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  30.87 
 
 		 516 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  33.21 
 
 		 537 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  32.69 
 
 		 513 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  31.76 
 
 		 518 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  32.69 
 
 		 513 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  30.31 
 
 		 532 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 528 aa  205  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  29.82 
 
 		 541 aa  203  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2405  extracellular solute-binding protein family 5  30.12 
 
 		 518 aa  202  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 528 aa  199  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  31.33 
 
 		 513 aa  199  9e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0337  extracellular solute-binding protein family 5  28.68 
 
 		 521 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  29.67 
 
 		 565 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  28.99 
 
 		 532 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.86 
 
 		 535 aa  198  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.03 
 
 		 505 aa  196  8.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  27.83 
 
 		 537 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  27.64 
 
 		 537 aa  194  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 490 aa  192  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.01 
 
 		 534 aa  192  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 		 531 aa  192  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  29.81 
 
 		 515 aa  191  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 520 aa  189  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  26.64 
 
 		 533 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04510  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.56 
 
 		 551 aa  187  5e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  28.96 
 
 		 503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  30.53 
 
 		 524 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 531 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  29.91 
 
 		 532 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  29.15 
 
 		 502 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 		 531 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.1 
 
 		 520 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0370  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 497 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.735975  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 		 531 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 506 aa  182  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 520 aa  182  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 532 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.22 
 
 		 510 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  27.38 
 
 		 532 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 522 aa  181  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 531 aa  181  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 510 aa  180  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  26.26 
 
 		 535 aa  179  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  28.51 
 
 		 540 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.92 
 
 		 531 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1235  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.81 
 
 		 542 aa  178  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650831  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.07 
 
 		 528 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.65 
 
 		 504 aa  178  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  25.7 
 
 		 533 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 531 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  28.95 
 
 		 546 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  29.46 
 
 		 520 aa  178  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  27.18 
 
 		 532 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  28.05 
 
 		 531 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 501 aa  177  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 531 aa  177  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0091  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.9 
 
 		 528 aa  177  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3091  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.9 
 
 		 528 aa  177  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 535 aa  177  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2283  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.9 
 
 		 528 aa  177  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2005  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.9 
 
 		 528 aa  177  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  28.73 
 
 		 510 aa  176  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.74 
 
 		 526 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.74 
 
 		 526 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.9 
 
 		 528 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  28.73 
 
 		 519 aa  176  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.74 
 
 		 526 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  28.21 
 
 		 509 aa  176  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 509 aa  176  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 509 aa  176  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 541 aa  176  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 535 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.69 
 
 		 528 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  27.23 
 
 		 531 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 520 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.74 
 
 		 526 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 		 525 aa  176  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 531 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  27.43 
 
 		 497 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  27.73 
 
 		 520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  27.73 
 
 		 520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.73 
 
 		 520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  27.73 
 
 		 520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0422  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.69 
 
 		 528 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 540 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 534 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>