More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2078 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
550 aa  1136    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  55.43 
 
 
561 aa  624  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  55.33 
 
 
554 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  54.96 
 
 
554 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  35.81 
 
 
523 aa  309  9e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  31.74 
 
 
538 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 
529 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  27.39 
 
 
529 aa  193  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  27.84 
 
 
529 aa  191  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  29.52 
 
 
516 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5692  extracellular solute-binding protein family 5  25.85 
 
 
555 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  27.01 
 
 
527 aa  183  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  27.11 
 
 
526 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  28.93 
 
 
512 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 
520 aa  172  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  29.86 
 
 
496 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 
525 aa  171  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  27.73 
 
 
522 aa  170  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
529 aa  167  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  26.24 
 
 
537 aa  167  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.17 
 
 
537 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  27.72 
 
 
532 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.6 
 
 
516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  28.17 
 
 
518 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.61 
 
 
532 aa  161  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  28.37 
 
 
505 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6274  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 
511 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0245039 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 
521 aa  160  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  27.99 
 
 
538 aa  158  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.29 
 
 
521 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 
519 aa  156  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  28.33 
 
 
531 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  26.77 
 
 
536 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.01 
 
 
545 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  26.01 
 
 
545 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  27.88 
 
 
565 aa  153  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.52 
 
 
510 aa  153  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
513 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 
535 aa  152  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 
509 aa  151  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 
528 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.63 
 
 
520 aa  150  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 
527 aa  150  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  25.76 
 
 
527 aa  150  7e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 
537 aa  150  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3524  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.91 
 
 
534 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.413747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  24.71 
 
 
535 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  29.3 
 
 
517 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 
534 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  26.2 
 
 
531 aa  147  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 
534 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 
536 aa  146  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 
517 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.33 
 
 
526 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.87 
 
 
525 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 
517 aa  144  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  26.14 
 
 
513 aa  144  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 
515 aa  143  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  25.74 
 
 
516 aa  143  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  24.36 
 
 
540 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  25.59 
 
 
536 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.89 
 
 
535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  25.58 
 
 
513 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 
535 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.25 
 
 
542 aa  141  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 
510 aa  141  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 
532 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 
512 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 
512 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 
512 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  23.52 
 
 
524 aa  140  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
540 aa  140  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  25.6 
 
 
525 aa  140  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4561  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.49 
 
 
531 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2156  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
543 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.470572  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 
511 aa  139  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.54 
 
 
540 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
517 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  24.8 
 
 
522 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  28.32 
 
 
540 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 
540 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 
526 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1189  4-phytase  29.08 
 
 
523 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 
515 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  28.09 
 
 
528 aa  136  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  26.79 
 
 
520 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
510 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  24.33 
 
 
509 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  27.77 
 
 
538 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.29 
 
 
534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 
520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4238  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 
531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301487  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  25.47 
 
 
502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 
535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0925  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 
536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  25.43 
 
 
515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  24.36 
 
 
526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.22 
 
 
508 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4296  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
531 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257984  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>