More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6426 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  82.23 
 
 		 529 aa  927    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 529 aa  1097    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  96.22 
 
 		 529 aa  1065    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  67.3 
 
 		 529 aa  778    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  66.21 
 
 		 526 aa  743    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  55.66 
 
 		 527 aa  593  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  44.32 
 
 		 525 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  46.31 
 
 		 520 aa  442  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  43.35 
 
 		 522 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  43.43 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  41.36 
 
 		 513 aa  392  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  43.25 
 
 		 518 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6274  extracellular solute-binding protein family 5  39.76 
 
 		 511 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0245039 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  41.42 
 
 		 496 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  39.88 
 
 		 512 aa  347  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  37.16 
 
 		 538 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6090  extracellular solute-binding protein family 5  36.9 
 
 		 538 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  39.33 
 
 		 535 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  38.65 
 
 		 519 aa  334  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  39.17 
 
 		 535 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3524  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  40.4 
 
 		 534 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.413747  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  39.13 
 
 		 535 aa  333  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  36.95 
 
 		 540 aa  332  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  39.19 
 
 		 534 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 534 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  36.61 
 
 		 539 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  35.16 
 
 		 536 aa  317  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  37.5 
 
 		 540 aa  314  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  36.21 
 
 		 545 aa  309  9e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  35.58 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  35.58 
 
 		 537 aa  303  4.0000000000000003e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  35.65 
 
 		 545 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  36.01 
 
 		 513 aa  297  3e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.92 
 
 		 526 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  35.34 
 
 		 527 aa  296  7e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  34.88 
 
 		 509 aa  295  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  34.44 
 
 		 535 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  35.26 
 
 		 536 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6354  extracellular solute-binding protein  36.33 
 
 		 527 aa  293  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6057  extracellular solute-binding protein  36.33 
 
 		 527 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  34.68 
 
 		 536 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6444  twin-arginine translocation pathway signal  36.12 
 
 		 527 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6679  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component  36.12 
 
 		 527 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6277  extracellular solute-binding protein  36.12 
 
 		 527 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0281814  normal  0.114415 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  33.59 
 
 		 537 aa  287  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  32.82 
 
 		 537 aa  276  9e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 		 515 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  31.97 
 
 		 516 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.95 
 
 		 516 aa  226  9e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  29.84 
 
 		 532 aa  213  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 		 513 aa  203  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  29.23 
 
 		 538 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 517 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 		 517 aa  197  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 561 aa  196  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3338  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 		 524 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 550 aa  193  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5692  extracellular solute-binding protein family 5  29.01 
 
 		 555 aa  191  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 517 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 523 aa  184  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0576  extracellular solute-binding protein family 5  28.06 
 
 		 533 aa  182  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3559  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 		 526 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  28.52 
 
 		 538 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.25 
 
 		 554 aa  177  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3973  extracellular solute-binding protein family 5  31.2 
 
 		 505 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617507  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  26.44 
 
 		 554 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  29.26 
 
 		 503 aa  170  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  28.96 
 
 		 502 aa  164  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.54 
 
 		 510 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3756  putative peptide ABC transporter, substrate- binding protein  27.99 
 
 		 514 aa  156  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279615  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2062  twin-arginine translocation pathway signal  25.84 
 
 		 550 aa  150  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.511061  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1360  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 543 aa  147  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0151381 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2156  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 543 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.470572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 522 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 521 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 511 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 549 aa  140  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 516 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2463  twin-arginine translocation pathway signal  25.67 
 
 		 555 aa  139  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31086  hitchhiker  0.000559828 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  28.23 
 
 		 514 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 510 aa  139  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  27.96 
 
 		 522 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  27.96 
 
 		 526 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 512 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  28.54 
 
 		 514 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3049  twin-arginine translocation pathway signal  26.58 
 
 		 554 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1417  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 555 aa  134  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  27.52 
 
 		 525 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  28.33 
 
 		 508 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  26.14 
 
 		 527 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  27.77 
 
 		 516 aa  131  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  26.85 
 
 		 516 aa  130  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.58 
 
 		 520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4327  putative ABC transporter, extracellular substrate binding protein  27.82 
 
 		 538 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6191  extracellular solute-binding protein family 5  26.24 
 
 		 504 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172417  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  27.04 
 
 		 565 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.46 
 
 		 512 aa  128  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 510 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  26.98 
 
 		 519 aa  127  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  25.56 
 
 		 510 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>