More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5692 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5692  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 555 aa  1157    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2062  twin-arginine translocation pathway signal  37.89 
 
 		 550 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.511061  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2156  extracellular solute-binding protein  37.41 
 
 		 543 aa  333  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.470572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1360  extracellular solute-binding protein  37.41 
 
 		 543 aa  329  9e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0151381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1417  twin-arginine translocation pathway signal  36.53 
 
 		 555 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2463  twin-arginine translocation pathway signal  35.14 
 
 		 555 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31086  hitchhiker  0.000559828 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3049  twin-arginine translocation pathway signal  34.38 
 
 		 554 aa  299  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1490  extracellular solute-binding protein family 5  34.63 
 
 		 555 aa  286  5.999999999999999e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.758744 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2703  ABC dipeptide transporter, periplasmic binding protein  36.53 
 
 		 501 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22446  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 523 aa  209  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 561 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 525 aa  197  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  27.32 
 
 		 554 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.42 
 
 		 554 aa  193  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  29.01 
 
 		 529 aa  191  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  28.13 
 
 		 527 aa  190  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  28.83 
 
 		 529 aa  191  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 529 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 		 538 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 550 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  28.47 
 
 		 545 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 529 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.95 
 
 		 545 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  26.17 
 
 		 526 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 520 aa  171  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  27.63 
 
 		 522 aa  170  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 535 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 539 aa  167  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  28.49 
 
 		 532 aa  163  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  25.81 
 
 		 535 aa  163  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  26.97 
 
 		 518 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 		 536 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.59 
 
 		 537 aa  161  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 535 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3787  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 531 aa  160  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.216169  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 517 aa  160  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5167  4-phytase  28.33 
 
 		 530 aa  160  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal  0.719428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  27.55 
 
 		 537 aa  160  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 535 aa  160  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  25.86 
 
 		 512 aa  159  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0504  ABC transporter substrate-binding protein  28.5 
 
 		 531 aa  159  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.325614  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.25 
 
 		 516 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 519 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 		 505 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  27.37 
 
 		 516 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 535 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 509 aa  157  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 517 aa  154  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 536 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 513 aa  150  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  26.21 
 
 		 513 aa  150  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.14 
 
 		 526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 536 aa  147  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 		 502 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  25.15 
 
 		 496 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 527 aa  144  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.24 
 
 		 535 aa  143  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  26.88 
 
 		 532 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  26.88 
 
 		 532 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  25.69 
 
 		 540 aa  141  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 540 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 544 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.02 
 
 		 534 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 538 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 519 aa  139  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  26.39 
 
 		 528 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  24.12 
 
 		 533 aa  138  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 493 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 		 509 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  26.25 
 
 		 535 aa  137  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6274  extracellular solute-binding protein family 5  24.67 
 
 		 511 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0245039 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  24.8 
 
 		 531 aa  137  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.3 
 
 		 540 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 522 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 537 aa  137  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  25.64 
 
 		 538 aa  136  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 515 aa  135  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 489 aa  134  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  26.38 
 
 		 545 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  25.26 
 
 		 519 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3737  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.96 
 
 		 539 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 534 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  28.78 
 
 		 508 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  24.31 
 
 		 532 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  26.55 
 
 		 514 aa  130  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 538 aa  130  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  26.79 
 
 		 527 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  27.35 
 
 		 540 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  24.42 
 
 		 503 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 525 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  24.75 
 
 		 575 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.55 
 
 		 575 aa  128  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.33 
 
 		 543 aa  128  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 528 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 517 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 512 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3559  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 526 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>