More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2062 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2062  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 550 aa  1137    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.511061  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2156  extracellular solute-binding protein  51.51 
 
 		 543 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.470572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1360  extracellular solute-binding protein  50 
 
 		 543 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0151381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1417  twin-arginine translocation pathway signal  51.32 
 
 		 555 aa  540  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2463  twin-arginine translocation pathway signal  48.01 
 
 		 555 aa  517  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31086  hitchhiker  0.000559828 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1490  extracellular solute-binding protein family 5  48.41 
 
 		 555 aa  511  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.758744 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2703  ABC dipeptide transporter, periplasmic binding protein  51.36 
 
 		 501 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22446  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3049  twin-arginine translocation pathway signal  50.36 
 
 		 554 aa  510  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5692  extracellular solute-binding protein family 5  37.89 
 
 		 555 aa  357  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 		 525 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 529 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 520 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  26.46 
 
 		 529 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  25.8 
 
 		 529 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 523 aa  158  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  26.98 
 
 		 513 aa  145  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.56 
 
 		 510 aa  135  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.86 
 
 		 516 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  25.47 
 
 		 516 aa  133  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 		 510 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 550 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  25.53 
 
 		 538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 		 527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  26.33 
 
 		 538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 529 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  27.05 
 
 		 516 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.95 
 
 		 545 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 		 506 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 		 512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 		 511 aa  127  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  24.72 
 
 		 526 aa  127  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.62 
 
 		 524 aa  126  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.25 
 
 		 505 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 544 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 517 aa  126  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  23.66 
 
 		 527 aa  125  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 515 aa  123  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  24.82 
 
 		 532 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3559  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 526 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  25.16 
 
 		 502 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 517 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  22.6 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 		 536 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0139  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 502 aa  121  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.184027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 512 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 512 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 512 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.05 
 
 		 537 aa  120  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 501 aa  120  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  24.82 
 
 		 532 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  26.75 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 494 aa  119  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 531 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 527 aa  119  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.95 
 
 		 532 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 532 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 534 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.98 
 
 		 520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 530 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 510 aa  117  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 538 aa  117  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  27.16 
 
 		 520 aa  117  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 528 aa  117  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 561 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  23.69 
 
 		 541 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.86 
 
 		 539 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  26.01 
 
 		 503 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 534 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 490 aa  114  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 528 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 513 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  27.03 
 
 		 517 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  25.73 
 
 		 537 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4354  extracellular solute-binding protein family 5  26.8 
 
 		 497 aa  114  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148655  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 		 531 aa  114  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 532 aa  113  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  23.46 
 
 		 554 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.39 
 
 		 508 aa  114  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  24.53 
 
 		 540 aa  113  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  26.01 
 
 		 509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  23.37 
 
 		 518 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.73 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  24.05 
 
 		 530 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  27.75 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1499  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.779721  normal  0.296474 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  28.76 
 
 		 531 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  25.3 
 
 		 496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 519 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  23.54 
 
 		 540 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  23.87 
 
 		 502 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.34 
 
 		 535 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 		 538 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 526 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  24.63 
 
 		 535 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  29.74 
 
 		 524 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 533 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>