More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2463 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2463  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 555 aa  1147    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31086  hitchhiker  0.000559828 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1490  extracellular solute-binding protein family 5  57.82 
 
 		 555 aa  637    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.758744 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1417  twin-arginine translocation pathway signal  58.68 
 
 		 555 aa  637    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2156  extracellular solute-binding protein  56.05 
 
 		 543 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.470572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1360  extracellular solute-binding protein  54.75 
 
 		 543 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0151381 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2703  ABC dipeptide transporter, periplasmic binding protein  55.2 
 
 		 501 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22446  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2062  twin-arginine translocation pathway signal  48.01 
 
 		 550 aa  512  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.511061  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3049  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 		 554 aa  510  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5692  extracellular solute-binding protein family 5  35.87 
 
 		 555 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 529 aa  151  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  25.62 
 
 		 529 aa  144  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  25.76 
 
 		 529 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.8 
 
 		 535 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 535 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  24.66 
 
 		 513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  27.15 
 
 		 527 aa  134  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 535 aa  134  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  28.21 
 
 		 522 aa  134  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.38 
 
 		 554 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 523 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  25.95 
 
 		 538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  26.18 
 
 		 545 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.18 
 
 		 545 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 561 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  24.62 
 
 		 554 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3524  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.03 
 
 		 534 aa  127  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.413747  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 540 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.54 
 
 		 540 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.57 
 
 		 516 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 534 aa  124  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 525 aa  124  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 519 aa  123  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  26.54 
 
 		 532 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  27.36 
 
 		 540 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.13 
 
 		 537 aa  120  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 537 aa  117  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 529 aa  117  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 538 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  24.64 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 		 537 aa  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 527 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 539 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  23.93 
 
 		 535 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 515 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  26.48 
 
 		 558 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 494 aa  110  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  23.59 
 
 		 518 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.84 
 
 		 526 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  26.08 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  24.52 
 
 		 526 aa  110  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  23.83 
 
 		 512 aa  107  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 522 aa  107  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.58 
 
 		 538 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 519 aa  106  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6277  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 527 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0281814  normal  0.114415 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 550 aa  105  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6444  twin-arginine translocation pathway signal  23.44 
 
 		 527 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6679  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component  23.44 
 
 		 527 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 595 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  24.94 
 
 		 506 aa  104  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 529 aa  104  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  25 
 
 		 529 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 529 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6090  extracellular solute-binding protein family 5  22.29 
 
 		 538 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6354  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 527 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 495 aa  103  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6057  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 527 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.74 
 
 		 524 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 544 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.65 
 
 		 520 aa  102  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  25.05 
 
 		 514 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  23.93 
 
 		 516 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 		 520 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 520 aa  101  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  23.63 
 
 		 540 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 517 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 535 aa  100  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 535 aa  100  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  28.53 
 
 		 520 aa  100  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.34 
 
 		 534 aa  99.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 538 aa  100  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 517 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 516 aa  100  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 492 aa  99.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  29.65 
 
 		 520 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 540 aa  98.2  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  24.29 
 
 		 516 aa  97.8  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  23.6 
 
 		 536 aa  98.2  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5167  4-phytase  26.42 
 
 		 530 aa  97.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal  0.719428 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  30.13 
 
 		 520 aa  97.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 		 537 aa  97.4  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  23.23 
 
 		 540 aa  97.1  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 516 aa  97.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  24.48 
 
 		 502 aa  97.1  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 517 aa  97.1  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0139  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 502 aa  96.7  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.184027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  24.28 
 
 		 538 aa  96.3  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  29.35 
 
 		 520 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>