More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2105 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
538 aa  1065    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  33.6 
 
 
545 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  32.8 
 
 
545 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  34.31 
 
 
513 aa  244  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 
539 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  34.63 
 
 
527 aa  236  7e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  33.26 
 
 
520 aa  233  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 
519 aa  232  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  32.87 
 
 
516 aa  229  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  31.53 
 
 
536 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.17 
 
 
537 aa  229  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 
536 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  30.47 
 
 
540 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  34.03 
 
 
509 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 
535 aa  226  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  31.31 
 
 
536 aa  225  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  31.3 
 
 
535 aa  224  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.16 
 
 
538 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  30.72 
 
 
513 aa  221  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6090  extracellular solute-binding protein family 5  30.12 
 
 
538 aa  221  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194048  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 
529 aa  217  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 
540 aa  217  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 
525 aa  213  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6277  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 
527 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0281814  normal  0.114415 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6444  twin-arginine translocation pathway signal  30.67 
 
 
527 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6679  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component  30.67 
 
 
527 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140574  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  33.97 
 
 
517 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.57 
 
 
526 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 
529 aa  210  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6354  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 
527 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6057  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 
527 aa  208  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  30.19 
 
 
526 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  29.67 
 
 
529 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  29.47 
 
 
529 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  33.61 
 
 
517 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 
519 aa  200  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  30.18 
 
 
527 aa  200  7e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  33.74 
 
 
503 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  29.29 
 
 
532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  29.81 
 
 
518 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  30.75 
 
 
522 aa  194  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 
537 aa  194  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3756  putative peptide ABC transporter, substrate- binding protein  31.49 
 
 
514 aa  193  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279615  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  29.88 
 
 
537 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  28.55 
 
 
561 aa  188  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 
535 aa  186  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  30.06 
 
 
535 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.94 
 
 
516 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.12 
 
 
554 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6274  extracellular solute-binding protein family 5  27.86 
 
 
511 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0245039 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 
535 aa  183  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  28.39 
 
 
554 aa  182  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  32.25 
 
 
534 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 
513 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  30.37 
 
 
502 aa  179  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  29.37 
 
 
496 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  31.01 
 
 
538 aa  176  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3524  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  31.17 
 
 
534 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.413747  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  28.12 
 
 
512 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  31.39 
 
 
534 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 
550 aa  171  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  30.72 
 
 
523 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0576  extracellular solute-binding protein family 5  28.66 
 
 
533 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.82 
 
 
505 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3973  extracellular solute-binding protein family 5  35.12 
 
 
505 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617507  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 
515 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5692  extracellular solute-binding protein family 5  26 
 
 
555 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.63 
 
 
512 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
529 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
522 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.98 
 
 
510 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.33 
 
 
534 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2156  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 
543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.470572  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.7 
 
 
535 aa  135  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  29.11 
 
 
508 aa  134  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  28.29 
 
 
522 aa  133  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 
510 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5711  extracellular solute-binding protein family 5  29.77 
 
 
550 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4041  extracellular solute-binding protein family 5  25.84 
 
 
543 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457031  normal  0.172562 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0586  extracellular solute-binding protein family 5  25.63 
 
 
544 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0112  extracellular solute-binding protein family 5  28.3 
 
 
524 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214652  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  27.91 
 
 
523 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 
528 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2062  twin-arginine translocation pathway signal  26.33 
 
 
550 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.511061  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3338  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 
524 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165624  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 
510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 
510 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  26.8 
 
 
514 aa  127  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 
531 aa  126  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  25.83 
 
 
497 aa  126  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 
541 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  25.56 
 
 
520 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  28.69 
 
 
524 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  27.78 
 
 
529 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1360  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 
543 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0151381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  27.1 
 
 
509 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 
534 aa  124  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
515 aa  124  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 
529 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.1 
 
 
508 aa  123  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>